检索规则说明:AND代表“并且”;OR代表“或者”;NOT代表“不包含”;(注意必须大写,运算符两边需空一格)
检 索 范 例 :范例一: (K=图书馆学 OR K=情报学) AND A=范并思 范例二:J=计算机应用与软件 AND (U=C++ OR U=Basic) NOT M=Visual
作 者:万迅 游绍伟 彭晓婷 王文素 何典城 詹亚梅[4] 李姗姗
机构地区:[1]贵州中医药大学,贵阳市550000 [2]贵州中医药大学第二附属医院,贵阳市550000 [3]黔西南州中医医院,贵州省兴义市562400 [4]贵州省人民医院,贵阳市550000
出 处:《临床合理用药》2025年第6期84-89,F0003,共7页Chinese Journal of Clinical Rational Drug Use
基 金:贵州省科技计划项目(黔科合基础-ZK〔2022〕一般502)。
摘 要:目的通过网络药理学联合分子对接技术探讨金荞麦主要活性成分治疗慢性萎缩性胃炎(CAG)的作用机制。方法利用TCMSP数据库获取金荞麦的有效成分和靶点,以“Chronic Atrophic Gastritis”为关键词检索OMIM、DisGeNET、GeneCards数据库以获取CAG疾病靶点,将金荞麦有效成分靶点与CAG疾病靶点导入R 4.2.0软件制作韦恩图,得到金荞麦-CAG交集靶点。将金荞麦-CAG交集基因输入STRING 11.0数据库进行PPI分析,基于“连接度”“亲和中心性”“间性中心性”参数对PPI网络进行拓扑分析,根据网络拓扑学参数判断CAG核心靶点。将“金荞麦-CAG共同靶点”导入R 4.2.0软件,使用ClsuterProfiler程序包进行GO生物功能富集分析和KEGG通路富集分析。将金荞麦有效成分、关键靶点和KEGG信号通路导入Cytoscape 3.8.2软件,绘制“有效成分—关键靶点—通路”网络图。将金荞麦有效成分与筛选出的CAG疾病核心靶点进行分子对接验证。结果获得金荞麦-CAG交集靶点68个。使用Cytoscape 3.8.2软件中“Analysis Network”工具得出连接度、亲和中心性、间性中心性排前5的核心靶点分别为丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、抑癌基因p53(TP53)、肿瘤坏死因子(TNF)、白介素-6(IL-6)。GO生物功能富集分析结果显示,生物学过程主要涉及外源性凋亡信号通路、氧化应激反应、脂多糖反应、细菌来源分子反应、细胞对化学应激的反应等;细胞组分主要涉及囊泡腔、分泌颗粒腔、细胞质囊泡腔、膜筏等;分子功能主要涉及细胞因子受体结合、细胞因子活性、受体配体活性、信号受体激活活性、激酶调节活性等。KEGG通路富集分析共得到138条与CAG相关通路,将主要涉及PI3K-Akt信号通路、AGE-RAGE信号通路、脂质与动脉粥样硬化、人类巨细胞病毒感染、流体剪切力与动脉粥样硬化、TNF信号通路、白介素-17信号通路等�
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