检索规则说明:AND代表“并且”;OR代表“或者”;NOT代表“不包含”;(注意必须大写,运算符两边需空一格)
检 索 范 例 :范例一: (K=图书馆学 OR K=情报学) AND A=范并思 范例二:J=计算机应用与软件 AND (U=C++ OR U=Basic) NOT M=Visual
作 者:王一诺 张竞尧 黄蔚 高杰 冯丹丹 杨天殊 杨云凯 苑宝文 高天杨 郝鑫慧 刘瑞琼 滕旭[2] 余和芬[2] 王艳
机构地区:[1]国家癌症中心/国家肿瘤临床医学研究中心/中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院/分子肿瘤学国家重点实验室,北京100021 [2]肿瘤侵袭和转移机制研究北京市重点实验室/首都医科大学基础医学院生物化学与分子生物学系,北京100069 [3]天津医科大学基础医学院生物化学与分子生物学系/免疫微环境与疾病教育部重点实验室,天津300070
出 处:《内蒙古医科大学学报》2025年第1期50-57,共8页Journal of Inner Mongolia Medical University
基 金:国家自然科学基金项目(42125707,41931291,82273403,81902882);中国医学科学院中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目(2019PT310027,2021-RC310-006);中国医学科学院医学科学创新基金项目(2021-I2M-1-018)。
摘 要:目的探讨免疫和基质细胞相关基因对三阴性乳腺癌(triple-negative breast cancer,TNBC)预后的影响。方法利用ESTIMATE算法计算GEO数据库中TNBC样本的免疫评分,使用R包中的limma包筛选差异表达基因。GEO数据库和KM-plotter网站进行生存分析,寻找与TNBC无病生存期显著相关的基因。通过免疫组织化学染色和RT-qPCR验证其中部分基因的表达水平。结果功能富集和蛋白-蛋白相互作用网络分析显示这些基因主要参与免疫应答。R包中survival包生存分析显示,36个基因中有14个基因与TNBC的DFS显著相关。Cox-LASSO分析筛选出4个与TNBC预后相关的基因。时间依赖的受试者工作特征分析显示,1年生存率的曲线下面积(area under the curve,AUC)为0.95,表明4个基因具有很好的预后预测能力。结论含杆状病毒IAP重复3(baculoviral IAP repeat containing 3,BIRC3)基因、CD8抗原(CD8 antigen,CD8A)基因、颗粒溶素(granulysin,GNLY)基因和含三方基序22(tripartite motif containing 22,TRIM22)基因这4个基因可能与TNBC的免疫微环境相关,是TNBC潜在的预后和治疗标志物。
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