基于生物信息学分析炎症性肠病与肝细胞癌相关性  

Correlation analysis between inflammatory bowel disease and hepatocellular carcinoma based on bioinformatics

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作  者:刘子雄 张晓晶 王培龙 张毅强[3] 赵婉彬 Liu Zixiong;Zhang Xiaojing;Wang Peilong;Zhang Yiqiang;Zhao Wanbin(Gastroenterology Department of Heping Hospital Affiliated to Changzhi Medical College,Changzhi,Shanxi 046000,China;Gastroenterology Department of Heji Hospital Affiliated to Changzhi Medical College,Shanxi 046000;Department of Biochemistry and Molecular Biology,Changzhi Medical College,Changzhi,Shanxi 046000)

机构地区:[1]长治医学院附属和平医院消化内科,山西长治046000 [2]长治医学院附属和济医院消化内科,山西长治046000 [3]长治医学院生物化学与分子生物学教研室,山西长治046000

出  处:《齐齐哈尔医学院学报》2025年第7期601-606,共6页Journal of Qiqihar Medical University

基  金:国家自然科学基金(31900038)。

摘  要:目的 本研究旨在通过生物信息学方法探讨肝细胞癌(HCC)与炎症性肠病(IBD)之间的基因相关性。方法 以“Hepatocellular carcinoma”和“Inflammatory bowel disease”为关键词,从GEO数据库下载基因表达矩阵。对下载的基因数据进行去重处理,并将两组靶基因进行映射以获得交集靶点。利用R软件进行GO功能和KEGG通路富集分析,使用STRING数据库构建蛋白质相互作用网络图,并通过CytoHubba插件中的MCC算法筛选出关键靶点。结果 研究中共获得HCC相关靶点2061个,IBD相关靶点2868个,两者交集靶点342个。通过R软件分析,得到了336项GO功能富集结果和20条KEGG信号通路,并筛选出10个关键靶点。结论 CCNB1、CCNA2、CDC20、BIRC5和KIF2C被确定为IBD和HCC的关键基因。此外,研究还发现E2F1、E2F3、E2F4、KLF4、KLF5、P53、YBX1、MYC、SP1、RELA和NFKB1可能调节这些关键基因。这些枢纽基因及其转录或转录后产物可能作为HCC和IBD连接机制的潜在治疗靶点。Objective To investigate the gene correlation between hepatocellular carcinoma(HCC)and inflammatory bowel disease(IBD)utilizing bioinformatics approaches.

关 键 词:炎症性肠病 肝细胞癌 生物信息学 基因富集分析 

分 类 号:R735.7[医药卫生—肿瘤]

 

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