籼稻细胞色素P450超基因家族成员及其EST证据  被引量:3

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作  者:钟兰[1] 李松岗[1] 王凯[2] 谭军[2] 李蔚[2] 

机构地区:[1]北京大学生命科学院,北京100871 [2]中国科学院基因组信息学中心暨华大基因研究中心,北京101300

出  处:《中国科学(C辑)》2002年第6期500-504,共5页Science in China(Series C)

摘  要:将预测的籼稻基因同289个已知的拟南芥细胞色素P450基因进行蛋白质序列比对,在籼稻(Oryza sativa L.ssp.indica)工作框架草图中找到了528个可能的细胞色素P450基因,初步认定上述籼稻P450基因来自于已在拟南芥中确定的40个P450基因家族.比较拟南芥和籼稻的细胞色素P450s在基因家族中的分布,发现这两种植物P450基因的家族分布规律总体相似,但也有不同,例如:CYP71,CYP72,CYP76,CYP89,CYP94,CYP709等家族的成员在籼稻中远远多于拟南芥的;CYP705家族的成员在籼稻中没有,但在拟南芥中却多达33个.另外,发现籼稻CYP71和CYP81家族的成员在基因组中成串联重复排列,它们可能是进化过程中基因复制的结果.进一步将这些籼稻P450基因的DNA序列同籼稻表达序列标签(expression sequence tags,ESTs)进行核酸序列比对,为263个可能的籼稻P450s找到了ESTs的证据,说明这些基因在转录水平上确实有所表达.

关 键 词:籼稻 细胞色素P450超基因 EST 表达序列标签 拟南芥 蛋白质序列 核酸序列 

分 类 号:S511.21[农业科学—作物学] Q78[生物学—分子生物学]

 

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