62种细菌基因组中密码子碱基位置上碱基分布的差异性及相关性  

THE BASE DISTRIBUTION IN CODON POSITION IS CORRELATED IN BACTERIA CODING SEQUENCE

作　　者：钟东[1] 赵贵军[2] 刘宇虎[1] 杨兴龙[1] 徐安龙[2] 张振书[1] 

机构地区：[1]第一军医大学南方医院消化疾病研究所,广东广州510515 [2]中山大学生命科学学院生物化学系,广东广州510275

出　　处：《中国微生态学杂志》2003年第3期134-136,共3页Chinese Journal of Microecology

基　　金：国家自然科学基金重点项目资助 (No 6993 5 0 2 0 ) ;国家自然科学基金项目资助 (No 3 0 1710 5 3 ) ;中山大学青年教师科研启动基金项目 (No 3 3 110 113 10 91)

摘　　要：应用生物信息学方法 ,对已完成测序的 6 2种细菌基因组进行 :1 同一密码子碱基位置上不同碱基分布频率的比较 ;2 不同密码子碱基位置上同一碱基分布频率的比较。结果显示 :1 三个密码子碱基位置上及四种碱基的分布频率差异存在显著性 ;2 三个密码子碱基位置上的四种碱基的分布频率显著相关。结论提示 ,在细菌的进化过程中 ,任一密码子碱基位置上任一碱基的分布有可能受到所处密码子碱基位置及其他三种碱基分布的影响。Using bioinformatics method,we compare the base distributions of three codon position in the coding sequency of 62 species bacteria,the result show:1.There are difference base distribution between the four bases.2.In the same codon position,the four base distributions is corelated;for each of four bases,the base distributions in three codon position is correlated.It suggests that every base distributions is influenced by other three's.

关 键 词：细菌 基因组 碱基分布 差异性 相关性 密码子碱基位置 

分 类 号：Q939.1[生物学—微生物学] Q754