碱基分布

作品数:8被引量:37H指数:4
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基因组翻译起始和终止区域碱基分布的信息熵分析被引量:1
《黑龙江大学自然科学学报》2011年第5期741-748,共8页詹青 王亚东 
DNA编码区域起始和终止位置的预测是生物信息学中的一个重要问题,对翻译起始和终止区域的序列特性分析是其中的关键。针对基因组翻译起始和终止区域的碱基分布,如保守性、周期性等问题,提出了一种基于信息熵方法的模型进行分析。对编码...
关键词:DNA 信息熵 起始密码子 
黑腹果蝇蛋白质编码区碱基分布与起始密码子及终止密码子的关系被引量:1
《内蒙古科技大学学报》2007年第4期341-344,共4页蔡禄 崔向军 刘辉 
国家自然科学基金资助项目(60761001);内蒙古自然科学基金重点资助项目(200508010102)
对黑腹果蝇染色体上基因组进行统计分析,结果表明,蛋白质编码区(CDS)碱基分布具有不均匀性.对单核苷酸、双核苷酸及密码子的使用进行统计,结果表明,与起始密码子对应的组分中,NTG的使用倾向值相对高,终止密码子(TGA,TAA,TAG)对应的组合...
关键词:起始密码子 终止密码子 碱基分布 黑腥果蝇 限制作用 
大肠杆菌基因结构的统计分析
《河北工业大学学报》2004年第4期58-62,共5页刘金伟 王永宏 
河北省教委科研项目资助(2002121)
详细研究大肠杆菌蛋白质编码基因的结构特征.对已知功能基因的组分进行统计分析,结果表明大肠杆菌基因中各种单核苷酸、双核苷酸及密码子出现频率有很大差异,与终止密码子相关的组分出现的频率很低.这表明终止密码子在不同层次上限制基...
关键词:基因组 基因 密码子 终止密码子 碱基分布 
蛋白质编码区碱基分布与终止密码子的关系被引量:1
《山东理工大学学报(自然科学版)》2004年第2期95-98,共4页齐立省 王永宏 展永 于慧 赵同军 纪青 
河北省教育厅基金项目
对11种具有不同G+C含量的微生物基因组蛋白质编码区进行统计分析,结果显示蛋白质编码区3个密码子位碱基分布具有明显的不对称性,与终止密码子对应的一些单、双核苷酸出现的频率很低,由此得出结论:终止密码子对编码区碱基的使用起重要限...
关键词:蛋白质编码区 碱基分布 终止密码子 基因组 保守性 
62种细菌基因组中密码子碱基位置上碱基分布的差异性及相关性被引量:4
《中国微生态学杂志》2003年第3期134-136,共3页钟东 赵贵军 刘宇虎 杨兴龙 徐安龙 张振书 
国家自然科学基金重点项目资助 (No 6993 5 0 2 0 ) ;国家自然科学基金项目资助 (No 3 0 1710 5 3 ) ;中山大学青年教师科研启动基金项目 (No 3 3 110 113 10 91)
应用生物信息学方法 ,对已完成测序的 6 2种细菌基因组进行 :1 同一密码子碱基位置上不同碱基分布频率的比较 ;2 不同密码子碱基位置上同一碱基分布频率的比较。结果显示 :1 三个密码子碱基位置上及四种碱基的分布频率差异存在显著性 ;...
关键词:细菌 基因组 碱基分布 差异性 相关性 密码子碱基位置 
基因组内碱基分布整体均衡与局部不均衡的研究进展被引量:18
《遗传》2002年第3期351-355,共5页钟东 赵贵军 张振书 徐安龙 
国家自然科学基金重点项目 ( 6 9935 0 2 0 )
近年来 ,随着各种基因组计划的相继完成 ,发现在各种生物体单核苷酸链水平上存在着A≌T ,G≌C的数量关系 ,但从几千个至十几万个碱基的范围来看 ,A≠T ,G≠C。从数学上可以证明 ,如果DNA双链之间碱基的突变率一致 ,则A≌T ,G≌C成立 ,...
关键词:基因组 碱基分布 整体均衡 局部不均衡 研究进展 生物信息学 
大肠杆菌基因编码区碱基分布非均匀性的研究被引量:6
《内蒙古大学学报(自然科学版)》1999年第5期579-583,共5页李宏 罗辽复 
国家自然科学基金
基于大肠杆菌 1292 个基因编码区.1)统计出了氨基酸丰度分布,与一般生物氨基酸丰度比较发现,构成大肠杆菌蛋白质的氨基酸中疏水氨基酸相对较多,小氨基酸相对较少,二硫键相对较少;2)发现编码区碱基分布的非均匀性与氨基酸...
关键词:大肠杆菌基因 编码区 碱基 非均匀分布 开始区 
Z曲线,显示和分析DNA序列的直观工具被引量:6
《自然杂志》1995年第1期34-37,共4页张任 张春霆 
基于正四面体的对称性,我们将一DNA序列与三维空间中一条曲线,称为Z曲线,建立起一、一对应映射。对于任一给定DNA序列,可求出唯一的一条Z曲线与之对应,反之亦然。Z曲线一般是具有丰富的折叠结构的三维空间曲线,它反映了DNA序列中碱基分...
关键词:Z曲线 DNA序列 碱基分布 计算机图形学 
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