蛋白质编码区

作品数:18被引量:56H指数:4
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DBN在蛋白质编码区识别问题中的应用研究被引量:2
《计算机工程与应用》2020年第4期247-255,共9页胡青渝 刘广臣 
教育部产学合作协同育人项目(No.201801034031);山东省本科教改面上项目(No.M2018X066);鲁东大学引进人才基金项目(No.LB2017005);国家级大学生创新创业训练计划项目(No.201710451150)
针对真核生物DNA序列中蛋白质编码区的识别问题,提出基于深度置信网络(Deep Belief Network,DBN)的组合模型。通过信号处理技术对真核生物的DNA序列进行数值转换,并结合统计学知识提取转换后DNA序列的数值特征;利用随机森林对所提取的...
关键词:编码区识别 信号处理 随机森林 深度置信网络(DBN) 短时傅里叶变换(STFT) 
五指山猪线粒体基因组全序列测定与分析被引量:5
《西北农业学报》2015年第7期16-22,共7页于萍 曹婷 赵春萍 刘雅芳 施力光 张立岭 侯冠彧 
中央级公益性科研院所基本业务费(1630032013020)
采用PCR及TA克隆测序技术,获得五指山猪线粒体基因组全序列(KJ909516),并对其特征进行具体分析。结果表明,五指山猪线粒体基因组序列全长16 689bp,碱基组成为A(34.7%)、C(26.2%)、G(13.3%)、T(25.8%),包含13个蛋白编码区,2个rRNA,22个t...
关键词:五指山猪 线粒体基因组 蛋白质编码区 控制区 
脑心肌炎病毒多聚蛋白编码区起始与终止区的密码子使用模式
《中国畜牧兽医文摘》2014年第12期96-96,共1页张瑜 
文中利用特定区域密码子使用偏嗜性对数公式分析了脑心肌炎病毒(Encephalomyocarditis virus,EMCV)多聚蛋白编码基因的翻译起始区域与翻译终止区域的密码子使用模式。结果表明,EMCV多聚蛋白编码区内翻译起始序列区的同义密码子使用...
关键词:同义密码子使用 蛋白质编码区 脑心肌炎病毒 多聚蛋白 翻译起始区 稀有密码子 开放阅读框 蛋白编码基因 
汉族儿童TPMT基因全蛋白编码区SNP检测与分析被引量:3
《临床检验杂志》2013年第9期683-686,共4页谢偲 岳丽杰 陈小文 郑苗苗 杨春兰 丁慧 任艳飞 
国家自然科学基金资助项目(30471830);深圳市科技计划重点项目(201101011)
目的分析汉族儿童巯嘌呤甲基转移酶(TPMT)基因的蛋白质编码区(CDS)突变,探讨其在急性白血病(AL)患儿中的单核苷酸多态性(SNP)。方法变性梯度凝胶电泳结合DNA测序检测103例AL患儿及111例对照组儿童的TPMT基因CDS碱基位点突变情况。结果...
关键词:巯嘌呤甲基转移酶 急性白血病 变性梯度凝胶电泳 蛋白质编码区 单核苷酸多态性 基因突变 
加窗窄通带滤波器蛋白质编码区预测算法被引量:5
《数据采集与处理》2013年第2期129-135,共7页马玉韬 车进 关欣 滕建辅 
国家自然科学基金(61162020)资助项目;宁夏自然科学基金(NZ1024)资助项目;宁夏高校科学研究项目(2011263)资助项目
改进Gabor小波变换(Modified Gabor wavelet transform,MGWT)蛋白质编码区预测算法给出的预测结果在当前所有的独立预测算法中准确率最高。本文提出了有限脉冲响应(Finite impulse response,FIR)加窗窄通带滤波器蛋白质编码区预测(Windo...
关键词:蛋白质编码区预测 窄通带滤波器 FIR滤波器 窗函数法 群延迟 
利用转基因技术造福人类
《中国农村科技》2012年第4期34-35,共2页王志兴 
微小核糖核酸(MicroRNA,miRNA)包括有很多成员(核苷酸序列不一样),主要是由非蛋白质编码区的基因组(DNA)序列转录而来.微小核糖核酸有较高的稳定性,不易被核糖核酸酶及一些不利环境条件所降解。这与编码蛋向质的信使核糖核酸...
关键词:转基因技术 蛋白质编码区 小核糖核酸 核苷酸序列 核糖核酸酶 人类 利用 信使核糖核酸 
DNA序列映射方法对蛋白质编码区预测准确率的影响被引量:7
《安徽农业科学》2012年第6期3234-3238,共5页马玉韬 张成 杨泽林 李琦 杨婷 
宁夏自然科学基金(NZ1024);宁夏高校科学研究项目(201027)资助
[目的]探讨当前主要的DNA序列映射方法对蛋白质编码区的预测准确率的影响,寻找有效的映射方法。[方法]以AC(Approxi-mate Correlation)为碱基层的预测准确率的测度,采用FIR(Finite Impulse Response)窄通带滤波器预测算法研究各种映射...
关键词:预测准确率 蛋白质编码区 映射方法 加窗 窄通带滤波器 
Cis-regulatory change and expression divergence between duplicate genes formed by genome duplication of Arabidopsis thaliana被引量:1
《Chinese Science Bulletin》2010年第22期2359-2365,共7页CHEN KeNian ZHANG YanBin TANG Tian SHI SuHua 
supported by the National Basic Research Program of China (2007CB815701, 2009ZX08010-0178);National Natural Science Foundation of China (30730008, 40976081, 30970208)
As an index of functional divergence, expression divergence between duplicate gene copies has been observed and correlated with protein coding sequence divergence and bias in gene functional classes. However, the chan...
关键词:全基因组 拟南芥 独联体 分歧 复形 监管 基因表达差异 蛋白质编码区 
基于支持向量机的蛋白质编码区辨识
《数据采集与处理》2010年第5期637-642,共6页郭烁 朱义胜 王庆辉 
国家自然科学基金(60671061)资助项目;校中青年科研启动基金(2;00424)资助项目;辽宁省教育厅科研计划(L2010438)资助项目;沈阳市科技项目应用基础研究计划(1081236-1-00)资助项目
提出一种新的真核蛋白质编码区位置预测算法。首先,用支持向量机辨识编码区密码子第一位碱基;然后用短时傅里叶变换分析支持向量机输出值序列的时频特性,进而精确定位编码区。仿真结果表明,该算法具有较高的编码区辨识精度。
关键词:蛋白质编码区 密码子 支持向量机 短时傅里叶变换 
南部非洲Khoisan人和Bantu人的全基因组
《科学中国人》2010年第4期40-40,共1页
南部非洲土著采猎人是已知最古老的现代人,他们的基因结构对于了解人类多样性具有重要的意义。基于线粒体和核标记研究显示以Khoisan人、San人或Bushmen人为代表的采猎人与其他人种间在着基因差异。然而,至今人类基因组全序列仅限于...
关键词:全基因组 南部非洲 基因组全序列 蛋白质编码区 全序列分析 美国科学家 基因结构 基因差异 
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