全序列分析

作品数:152被引量:725H指数:13
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东江水系大刺鳅线粒体基因组研究
《湖南农业科学》2025年第2期73-80,共8页王凯丰 陈锭娴 刘兰苑 林胜跃 张杰铭 梁巍骞 李强 桂林 
国家自然科学基金资助项目(41673110);2023年大学生创新训练项目国家级立项(202311078046);2024年大学生创新创业训练项目(XJ202411078131)。
采用PCR和DNA基因测序技术对东江大刺鳅线粒体基因组(mtDNA)测序,使用DNAstar、MEGA 11.0、MITOS Webserver、tRNAscan SE 1.21、Clustal Omega等软件对所测得序列进行分析、比对,了解其mtDNA结构与组成等特征。结果表明:东江大刺鳅mtDN...
关键词:线粒体基因组 全序列分析 系统发育 东江大刺鳅 
黄颈亚马逊鹦鹉线粒体基因组全序列分析及系统进化被引量:1
《基因组学与应用生物学》2024年第6期1066-1077,共12页陈云霞 黄娅琳 侯森林 周用武 
江苏高校“青蓝工程”(2021);“十四五”江苏省重点学科“公安技术”(2022);野生动植物物证技术国家林业和草原局重点实验室项目共同资助。
黄颈亚马逊鹦鹉(Amazona auropalliata)属于《濒危野生动植物种国际贸易公约》附录Ⅱ监管物种。为了更好地了解黄颈亚马逊鹦鹉的起源、进化以及在鹦形目中的系统发育地位,本研究使用一代直接测序法获得了黄颈亚马逊鹦鹉的线粒体基因组序...
关键词:黄颈亚马逊鹦鹉 线粒体基因组 结构特征 系统进化 
三角鲤线粒体基因组全序列测定及分析被引量:1
《安徽农业科学》2024年第5期108-111,120,共5页李强 李文俊 韩崇 鲁同富 龚剑 桂林 
广州市科技计划项目(201804010486);广东省教育科学规划课题(2021GXJK097)。
[目的]三角鲤(Cyprinus multitaeniata)是我国具有重要经济价值的鱼类之一,了解三角鲤线粒体基因的结构和特点,为三角鲤的种群遗传多样性研究提供基础资料。[方法]采用26对引物扩增三角鲤的线粒体全基因,通过生物软件识别和分析各基因...
关键词:三角鲤 线粒体基因组 全序列分析 系统发育 
貂熊线粒体基因组全序列分析及其系统进化
《野生动物学报》2023年第4期776-787,共12页张士芳 魏丹 郭媛 刘应竹 路平 刘凤春 朱世兵 
黑龙江省省属科研院所科研业务费项目(ZNJZ2020ZR01);黑龙江省科学院院长基金项目(YZ2021ZR01);黑龙江省科学院对外合作项目(DWHZ2023ZR01)。
为了更好地了解貂熊(Gulo gulo)的起源、进化等生物学信息,采用PCR方法克隆貂熊的线粒体基因组全序列,利用测序技术等常规分子生物学手段对其进行分析。结果显示:貂熊基因组序列全长为16575 bp;同其他哺乳动物相同,含13种蛋白质、22种转...
关键词:貂熊 线粒体基因组 系统进化 
新疆某马场马乳头瘤病毒1型全基因组测定及分析被引量:1
《动物医学进展》2021年第8期46-49,共4页宋小珍 佟盼盼 任美灵 张磊 买占海 况玲 谢金鑫 
新疆自然科学基金面上项目(2019D01A47);中国博士后科学基金面上项目(2019M653901XB);中国博士后科学基金第13批特别资助(站中)项目(2020T130555)
为探明引起新疆昌吉某马场呼吸困难纯血种公马鼻腔内乳头瘤样组织的病原,采集马鼻腔内乳头瘤样组织样品,采用高通量测序检测样品携带病毒多样性。结果显示,在乳头瘤样组织中检测到马乳头瘤病毒1型,命名为G2株。采用PCR方法扩增该病毒的...
关键词:马乳头瘤病毒1型 全序列分析 进化树 
塔里木兔线粒体基因组全序列分析与系统进化研究被引量:6
《野生动物学报》2021年第1期71-80,共10页黄娅琳 黄捷 时玉 徐燕红 周用武 侯森林 
中央高校基本科研业务费专项资金项目(LGZD202003)和预研项目(LGY201601)共同资助。
塔里木兔是我国新疆地区特有物种,已被列为国家Ⅱ级重点保护动物。本研究基于所测定的塔里木兔线粒体全基因组序列(全长17011 bp),进行了全序列的结构分析,结果表明塔里木兔线粒体基因组包含13个蛋白质编码基因、22个tRNA基因、2个rRNA...
关键词:塔里木兔 线粒体基因组 特征分析 遗传多样性 
沈阳花生上菜豆普通花叶病毒的鉴定与全序列分析
《沈阳大学学报(自然科学版)》2020年第6期464-470,共7页王筠竹 杨彩霞 于美春 侯秋实 
辽宁省自然科学基金资助项目(20180550863);辽宁省教育厅一般项目(L2015362).
2017年9月在辽宁沈阳采集到表现明显斑驳褪绿症状的花生样品,怀疑为植物病毒侵染所致.透射电镜负染色观察到约15 nm×800 nm的线性病毒粒子.选取明显病症样品进行转录组测序,原始数据经过滤拼接后进行同源搜索,显示该病毒与菜豆普通花...
关键词:花生 菜豆普通花叶病毒 转录组测序 分子鉴定 序列分析 
侵染‘舞美’苹果的苹果锈果类病毒检测与全序列分析被引量:4
《植物保护》2019年第4期176-179,共4页刘洪玉 孙子豪 李保华 王彩霞 
国家现代农业(苹果)产业技术体系(CARS-28);青岛农业大学大学生创新训练项目
2017年9月,在山东胶州调查苹果病毒病时发现‘舞美’果实表现出明显的花脸症状,取发病树体芽组织嫁接于健康‘富士’苹果幼树上,采用RT-PCR技术对其是否含有苹果锈果类病毒进行了检测,并利用DNAMAN、MEGA5.1等软件对其全序列进行了分析...
关键词:苹果锈果类病毒 '舞美’ RT-PCR 序列分析 
基于线粒体ATP6基因全序列分析中国绵羊痒螨(兔亚种)的遗传多样性被引量:4
《浙江农业学报》2019年第8期1231-1238,共8页尹潇潇 李燕方 古江 廖艳 谢跃 杨光友 古小彬 
国家自然科学基金青年科学基金(31402188)
为进一步了解我国绵羊痒螨(兔亚种)种群的遗传变异情况和分类情况,采用PCR技术扩增绵羊痒螨(兔亚种)虫株的线粒体ATP6基因全序列,并分析所得序列,旨在探讨中国华北、华东、华中、西北、西南地区绵羊痒螨(兔亚种)种群的遗传多样性和种群...
关键词:绵羊痒螨(兔亚种) 线粒体ATP 6基因 遗传多样性 
基于线粒体DNA D-loop区全序列分析儋州鸡遗传多样性及其起源进化关系被引量:6
《中国畜牧兽医》2019年第5期1439-1446,共8页李义书 侯冠彧 曹婷 施力光 周汉林 周雄 
海南省自然科学基金面上项目(318MS100);中国热带农业科学院基本科研业务费专项资金(1630032017061;1630032017030)
为了研究儋州鸡的遗传多样性及其起源进化关系,本研究对36只儋州鸡样品的线粒体DNA(mtDNA) D-loop区全序列进行PCR扩增和测序,结合GenBank中公布的部分品种鸡的mtDNA D-loop区全序列,利用生物信息学方法进行数据处理,分析儋州鸡的遗传...
关键词:儋州鸡 线粒体DNA(mtDNA) D-LOOP区 遗传多样性 起源 
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