同义密码子使用

作品数：24被引量：62H指数：5
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相关作者：黄笑宇郭小勤周建华石生林杨瑞生更多>>
相关机构：浙江农林大学西北民族大学中国农业科学院兰州兽医研究所东南大学更多>>
相关期刊：《黑龙江畜牧兽医》《浙江农林大学学报》《北京林业大学学报》《湖北民族大学学报（自然科学版）》更多>>
相关基金：国家自然科学基金国家现代农业产业技术体系建设项目黑龙江水产研究所基本科研业务费专项公益性行业(农业)科研专项更多>>
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BVDV-2d毒株的分离鉴定及同义密码子使用模式分析
《江苏农业学报》2024年第11期2111-2121,共11页杨宣叶 高明阳 胡欣妍 王进千 王慧慧 丁玉林 曹小安 马晓霞 
甘肃省自然科学基金项目(23JRRA715)。
本研究通过对腹泻犊牛肠道内容物中分离到的牛病毒性腹泻病毒(BVDV)毒株进行分析,首次确认该毒株为BVDV-2d亚型,命名为22-Gansu-F3。通过病毒分离、鉴定及全基因组测序,本研究不仅探讨了腹泻犊牛肠道的病理变化,还分析了其同义密码子使...
关键词：牛病毒性腹泻病毒 BVDV-2d 病理变化 同义密码子 遗传 
同义密码子使用模式控制核糖体扫描节律的分子机制
《农业生物技术学报》2024年第5期1178-1187,共10页高明阳 吴玉湖 杨宣叶 王进千 胡欣妍 周建华 
国家自然科学基金(32360874);甘肃省自然科学基金(23JRRA715);西北民族大学引进人才科研项目(xbmuyjrc202225)。
翻译过程中新生多肽链的正确折叠是蛋白质具备生物学活性的基石,但往往新生多肽链正确形成空间构象需通过共翻译折叠机制才能实现。在核糖体翻译mRNA序列时同义密码子使用模式的生物遗传学效应至关重要。越来越多的研究表明,虽然同义密...
关键词：多肽链 共翻译折叠 核糖体 同义密码子 停滞 
珙桐叶绿体基因组同义密码子使用偏好性分析被引量：3
《北京林业大学学报》2024年第3期8-16,共9页罗永坚 王茹 赵仁菲 卢新雄 尹广鹍 邓志军 
国家自然科学基金项目(31860073);生物资源保护与利用湖北省重点实验室2022年度开放基金(PT012212)。
【目的】珙桐是蓝果树科珙桐属唯一现存的第三纪孑遗植物,是我国一级保护的特有濒危树种。分析其叶绿体基因组同义密码子使用偏好性及其主要影响因素,旨在为珙桐分子水平上的深入研究、物种保护和种质创新提供参考。【方法】从NCBI在线...
关键词：珙桐 同义密码子偏好性 最优密码子 叶绿体基因组 氨基酸 
编码疾病相关的固有无序蛋白同义密码子使用偏好性的研究
《生物医学》2023年第4期368-377,共10页孙灿壮 冯永娥 
固有无序蛋白(简称IDPs)在生理条件下不具有稳定的空间结构,但是在生物体内发挥重要的生物学功能,除此之外,尤为重要的是它们与人类许多重大疾病密切相关。因此,研究疾病相关的IDPs,可以进一步了解IDPs与一系列疾病的病理学上的关系,这...
关键词：固有无序蛋白 同义密码子 密码子相对使用度 GC含量 方差分析 
水杉叶绿体基因组同义密码子使用偏好性被引量：3
《湖北民族大学学报（自然科学版）》2022年第2期121-128,共8页王茹 罗永坚 刘相泉 卢新雄 尹广鹍 邓志军 
国家自然科学基金项目(31860073);生物资源保护与利用湖北省重点实验室2020年度开放基金项目(PT012008).
水杉(Metasequoia glyptostroboides)是杉科水杉属唯一现存的孑遗种,也是我国一级保护的濒危特有树种,对其叶绿体基因组密码子使用偏好性及其主要影响因素进行分析,有利于水杉叶绿体基因组学研究、物种保护和种质创新.从在线数据库下载...
关键词：水杉 叶绿体基因组 同义密码子使用偏好性 碱基组成 自然选择 最优密码子 
同义密码子使用偏嗜性对mRNA半衰期及翻译调控的影响被引量：7
《生物工程学报》2022年第3期882-892,共11页李易聪 蒲飞洋 王慧慧 程燕 李倬 马忠仁 周建华 
甘肃省自然科学基金(20JR5RA505);中央高校基本科研业务费(31920200073)。
随着基因组学和转录组学在不同生物体遗传和细胞生物学领域的广泛应用,同义密码子使用的偏嗜性逐渐被接受,并且在研究生物进化与生物表型之间的深层联系时,同义密码子使用模式受到相关领域研究人员的重视。信使RNA(messenger RNA,mRNA)...
关键词：同义密码子使用模式 mRNA 精微调控翻译选择压力 转录 翻译 
河流型与沼泽型水牛LEP基因同义密码子使用特征分析
《黑龙江畜牧兽医》2017年第6期28-33,37,共7页范新阳 伍姗 张永云 滕晓红 赵学成 李卫真 苗永旺 
国家自然科学基金项目(31460582;30660024);云南省应用基础研究重点项目(2014FA032;2007C0003Z)
为了了解影响泌乳性状的重要编码基因LEP基因的密码子使用特征,试验以27头河流型水牛和41头沼泽型水牛为研究对象,并以从NCBI数据库中下载的普通牛、野牦牛、野牛、绵羊、山羊、小鼠和人的序列作对照,对两类水牛LEP基因的同义密码子使...
关键词：河流型水牛 沼泽型水牛 牛科物种 LEP基因 密码子偏好性 
基于全基因组的毛竹同义密码子使用偏好性分析被引量：9
《浙江农林大学学报》2017年第1期120-128,共9页黄笑宇 许在恩 郭小勤 
浙江省自然科学基金资助项目(Y307499;LY13C160011);国家自然科学基金资助项目(30901155);浙江省大学生新苗人才计划项目(2015R412020)
密码子使用偏好性是物种在遗传信息传递过程中的一个重要特点,分析物种的密码子使用偏好性对于了解该物种遗传信息的传递规律具有重要意义。应用Codon W软件对毛竹Phyllostachys edulis基因组中的26 103个蛋白质编码基因序列进行了分析...
关键词：植物学 毛竹 密码子偏好性 最优密码子 
冠状病毒同义密码子使用对mRNA二级结构的影响
《内蒙古大学学报（自然科学版）》2015年第6期609-618,共10页黄俏 李瑞芳 于志芬 李雪 
内蒙古自治区自然科学基金资助项目(2012MS0115);内蒙古自治区研究生教育创新计划资助项目(S20141013523);内蒙古师范大学研究生科研创新基金资助项目(CXJJS14061)
从NCBI中获得了45种冠状病毒的mRNA序列总计416条.分别计算了每条编码序列中相对同义密码子使用度(RSCU),然后预测每条mRNA序列的RNA二级结构,计算相应mRNA茎结构含量、环结构含量、单位平均折叠自由能以及mRNA柔性.由此,建立了冠状病毒...
关键词：冠状病毒 同义密码子使用度 MRNA二级结构 折叠自由能 mRNA柔性 
基于同义密码子使用的原核生物基因组大、小染色体及质粒进化特征分析被引量：2
《生物物理学报》2015年第3期272-285,共14页毕胜男 于家峰 任景 王吉华 
国家自然科学基金项目(61302186);东南大学生物电子学国家重点实验室开放基金~~
基于同义密码子偏好分析,对54个原核基因组大、小染色体及质粒中蛋白质编码基因的序列特征进行了对比分析。结果表明,大、小染色体中蛋白质编码基因的GC含量分布相近,质粒中蛋白质编码基因的GC含量分布与所在物种全基因组的GC含量差别...
关键词：原核生物基因组 大染色体 小染色体 质粒 同义密码子偏好 
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