同义密码子

作品数:97被引量:326H指数:10
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BVDV-2d毒株的分离鉴定及同义密码子使用模式分析
《江苏农业学报》2024年第11期2111-2121,共11页杨宣叶 高明阳 胡欣妍 王进千 王慧慧 丁玉林 曹小安 马晓霞 
甘肃省自然科学基金项目(23JRRA715)。
本研究通过对腹泻犊牛肠道内容物中分离到的牛病毒性腹泻病毒(BVDV)毒株进行分析,首次确认该毒株为BVDV-2d亚型,命名为22-Gansu-F3。通过病毒分离、鉴定及全基因组测序,本研究不仅探讨了腹泻犊牛肠道的病理变化,还分析了其同义密码子使...
关键词:牛病毒性腹泻病毒 BVDV-2d 病理变化 同义密码子 遗传 
普通核桃与深纹核桃中叶绿体基因组密码子使用特征对比被引量:2
《江苏农业学报》2024年第8期1507-1520,共14页朱艳 韩长志 
云南省研究生导师团队建设项目(2022100);云南省“兴滇英才支持计划”青年人才专项(YNWR-QNBJ-2020-188)。
本研究旨在对比分析普通核桃与深纹核桃中叶绿体基因组密码子的使用偏好性,对普通核桃与深纹核桃中各53条蛋白质编码区序列开展预测分析,明确上述2种核桃叶绿体基因组中的最优密码子,为未来开展核桃物种的亲缘关系研究提供理论依据。利...
关键词:普通核桃 深纹核桃 叶绿体 基因组 同义密码子 偏好性 
同义密码子使用模式控制核糖体扫描节律的分子机制
《农业生物技术学报》2024年第5期1178-1187,共10页高明阳 吴玉湖 杨宣叶 王进千 胡欣妍 周建华 
国家自然科学基金(32360874);甘肃省自然科学基金(23JRRA715);西北民族大学引进人才科研项目(xbmuyjrc202225)。
翻译过程中新生多肽链的正确折叠是蛋白质具备生物学活性的基石,但往往新生多肽链正确形成空间构象需通过共翻译折叠机制才能实现。在核糖体翻译mRNA序列时同义密码子使用模式的生物遗传学效应至关重要。越来越多的研究表明,虽然同义密...
关键词:多肽链 共翻译折叠 核糖体 同义密码子 停滞 
珙桐叶绿体基因组同义密码子使用偏好性分析被引量:3
《北京林业大学学报》2024年第3期8-16,共9页罗永坚 王茹 赵仁菲 卢新雄 尹广鹍 邓志军 
国家自然科学基金项目(31860073);生物资源保护与利用湖北省重点实验室2022年度开放基金(PT012212)。
【目的】珙桐是蓝果树科珙桐属唯一现存的第三纪孑遗植物,是我国一级保护的特有濒危树种。分析其叶绿体基因组同义密码子使用偏好性及其主要影响因素,旨在为珙桐分子水平上的深入研究、物种保护和种质创新提供参考。【方法】从NCBI在线...
关键词:珙桐 同义密码子偏好性 最优密码子 叶绿体基因组 氨基酸 
编码疾病相关的固有无序蛋白同义密码子使用偏好性的研究
《生物医学》2023年第4期368-377,共10页孙灿壮 冯永娥 
固有无序蛋白(简称IDPs)在生理条件下不具有稳定的空间结构,但是在生物体内发挥重要的生物学功能,除此之外,尤为重要的是它们与人类许多重大疾病密切相关。因此,研究疾病相关的IDPs,可以进一步了解IDPs与一系列疾病的病理学上的关系,这...
关键词:固有无序蛋白 同义密码子 密码子相对使用度 GC含量 方差分析 
同义密码子使用模式对多肽链共翻译折叠的影响研究进展被引量:1
《微生物学通报》2023年第7期3146-3158,共13页汪梦竹 胡欣妍 杨宣叶 高明阳 周建华 
西北民族大学引进人才科研项目(xbmuyjrc202225);中央高校基本科研业务费专项资金(31920220069);国家自然科学基金(31302100)。
同义密码子使用模式作为核苷酸与氨基酸的纽带,其多样性介导了核糖体扫描速率,同时扩充了基因的遗传信息存储量。随着新型技术的应用,发现特异性密码子和密码子结合力可调节核糖体扫描速率并影响蛋白质构象。同义密码子使用模式通过多...
关键词:同义密码子使用模式 遗传信息 基因表达 核糖体扫描 TRNA 
嗜热毛壳菌基因组密码子偏好性研究
《菌物学报》2023年第3期745-758,共14页戴明丹 秦丽娜 江贤章 
国家自然科学基金(31800060);福建省自然科学基金(2019I0009,2020J01177)。
嗜热毛壳菌具有强大的木质纤维素降解能力,将其开发为优异的重组蛋白表达宿主有着广阔的应用前景。蛋白表达宿主的密码子偏好性对重组蛋白的表达水平具有重大影响。为确定嗜热毛壳菌中密码子的使用模式及影响因素,本研究以6897条CDS序...
关键词:嗜热毛壳菌 密码子偏好性 相对同义密码子使用度 最优密码子 
重叠基因在异源蛋白表达中的新应用
《生物学杂志》2022年第6期101-107,共7页彭凯 逯晓云 卢丽娜 张娟琨 江会锋 
国家自然科学基金项目(31901015)。
大肠杆菌在调控异源蛋白的表达量和可溶性方面仍然存在困难。研究开发一种融合重叠基因结构和mRNA 5′-端序列优化的蛋白表达调控方法。在表达基因起始密码子前引入两个碱基TG,利用pET-28a质粒载体表达框的5′-端标签,与其形成TGATG的...
关键词:大肠杆菌 异源表达 同义密码子 mRNA结构 重叠基因 
一株牦牛源牛病毒性腹泻病毒毒株的分离鉴定及其遗传特性分析被引量:2
《浙江农业学报》2022年第11期2368-2378,共11页王慧慧 冯茜莉 汪梦竹 赵泽阳 李易聪 蒲飞洋 马鹏 李勇 龚真莉 马忠仁 马晓霞 
校企横向合作项目[2021西民合(科研)字第175号]。
通过病毒分离培养技术,从牦牛血清中分离获得一株致细胞病变的牛病毒性腹泻病毒(BVDV),命名为GSTZ毒株。经电镜观察,GSTZ毒株的直径在50~60 nm。按Karber法测算,该病毒滴度为5.0×10^(6.5) mL^(-1)[以组织半数感染量(TCID_(50))计]。利...
关键词:牛病毒性腹泻病毒 牦牛 基因1型 同义密码子 致细胞病变 
同义密码子通过精微翻译选择机制实现对基因的表达调控被引量:7
《微生物学报》2022年第10期3681-3695,共15页冯茜莉 王慧慧 汪梦竹 赵泽阳 周建华 
西北民族大学引进人才科研项目(xbmuyjrc202225);国家自然科学基金(31302100)
自然界中,同义密码子的存在使得众多氨基酸能够同时被多种密码子编码合成。随着研究的深入,同义密码子使用偏嗜性发挥出的生物学功能已经渗透到了基因复制、转录、翻译以及化学修饰等生命活动过程中。基于同义密码子使用偏嗜性的生物学...
关键词:同义密码子 精微翻译选择压力 调控 基因表达 生物工程 
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