重叠基因

作品数：24被引量：157H指数：5
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相关作者：胡宝成陈凤祥李强生张国培逯晓波更多>>
相关机构：中国医科大学安徽省农业科学院安徽省农作物品质改良重点实验室福建师范大学更多>>
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重叠基因在异源蛋白表达中的新应用
《生物学杂志》2022年第6期101-107,共7页彭凯 逯晓云 卢丽娜 张娟琨 江会锋 
国家自然科学基金项目(31901015)。
大肠杆菌在调控异源蛋白的表达量和可溶性方面仍然存在困难。研究开发一种融合重叠基因结构和mRNA 5′-端序列优化的蛋白表达调控方法。在表达基因起始密码子前引入两个碱基TG,利用pET-28a质粒载体表达框的5′-端标签,与其形成TGATG的...
关键词：大肠杆菌 异源表达 同义密码子 mRNA结构 重叠基因 
系统性硬化症相关间质性肺病、特发性肺纤维化与转化生长因子-β诱导的肺纤维化模型重叠基因的相关性分析被引量：4
《实用临床医药杂志》2022年第14期7-13,共7页丁丽丽 刘轩绮 孙晓林 高雅静 武志慧 王永福 
国家自然科学基金资助项目(81860294);内蒙古自治区自然科学基金资助项目(2019MS08055)。
目的利用生物信息学技术分析系统性硬化症相关间质性肺病(SSc-ILD)、特发性肺纤维化(IPF)与转化生长因子-β(TGF-β)诱导的肺纤维化模型重叠基因的相关性。方法通过Gene Expression Omnibus(GEO)数据库获取SSc-ILD、IPF与TGF-β诱导的...
关键词：转化生长因子-Β 系统性硬化症相关间质性肺病 特发性肺纤维化 生物信息学分析 
ERCC1及其重叠基因3’端非编码区多态性与结直肠癌发病风险关联的病例对照研究被引量：1
《中国医科大学学报》2021年第4期289-294,301,共7页张靖悦 张倩也 陈信桢 张国培 肖明扬 逯晓波 
国家自然科学基金(81773470);辽宁省教育厅2019年度科学研究经费项目(ZF2019034)。
目的探讨切除修复交叉互补基因1(ERCC1)及其重叠基因CD3EAP、PPP1R13L的3’端非编码区(3’UTR)单核苷酸多态性(SNP)与结直肠癌(CRC)发病风险的关联性。方法根据最小等位基因频率(MAF)及样本量确定候选SNP位点。收集200例CRC患者(病例组)...
关键词：结直肠癌 单核苷酸多态性 切除修复交叉互补基因1 3’端非编码区 重叠基因 
重叠基因结构及生物学功能的研究进展
《科教文汇》2020年第20期81-82,共2页郭振 吴娟(指导) 
安徽省教育厅自然科学项目(KJ2018A0356);安庆师范大学质量工程项目(2017jyxm018,2019aqnujyzc078)。
原核生物的基因组相对较小,蕴含遗传物质更少。为了经济高效利用有限遗传信息,生物体出现了重叠基因这种巧妙的应对机制。该文从重叠基因的结构、类型及生物学功能展开综述,以期对重叠基因的研究提供重要参考。
关键词：重叠基因 基因调控 真核生物 原核生物 病毒 
基于Hadoop的重叠基因对数量的计算方法
《福建师范大学学报（自然科学版）》2019年第6期29-39,共11页刘书田 江育娥 林劼 
国家自然科学基金资助项目(61472082);福建省自然科学基金资助项目(2014J01220)
基因组间的相似性可以通过重叠基因对的数量进行度量,基因组数据量的指数增长对重叠基因对数量的计算方法提出了更高的要求,业界迫切需要一种能够处理各种数量级别的基因数据库和待查询基因组的计算工具.本文提出一种基于Hadoop的重叠...
关键词：生物信息学 基因组 重叠基因对 大数据 HADOOP 
大肠杆菌基因组中重叠基因注释的机器学习优化方法被引量：3
《中国生物化学与分子生物学报》2018年第8期861-867,共7页杜明伦 黄君君 马香 唐燕琼 刘柱 
科技部国际合作专项(No.2015DFR31060);海南省重点研发计划(No.ZDYF2017020);海南省自然科学基金(No.317015);国家自然科学基金项目(No.31560021;31772887)资助~~
细菌基因组上存在着大量的重叠基因,这不但缩减基因组尺寸,增加对遗传信息的有效利用,而且参与转录及转录后水平的调控。目前重叠基因的形成原因尚不清楚,缺少预测重叠基因是否存在的特征信息,不利于对重叠基因的注释。本研究通过机器...
关键词：重叠基因 机器学习 卷积神经网络 功能注释 支持向量机 
基于SDNA-GA优化的模糊神经网络控制被引量：1
《控制与决策》2014年第4期731-734,共4页宋春宁 刘少东 
国家自然科学基金项目(60924002)
针对最新的生物DNA研究,病毒中同一DNA碱基顺序可以编码出2条或者3条不同的多肽链.在此基础上分析与模仿了重叠基因和重叠密码的机理,得到一种新的基于重叠基因编码框架,从而提高了问题求解的效率;同时,得到一种移码解读框架的DNA遗传算...
关键词：重叠基因编码框架 自适应变异 SDNA编码框架 遗传算法 T-S模糊神经网络 
家蚕质型多角体病毒基因组片段1中的假定重叠基因检测
《蚕业科学》2014年第1期45-51,共7页张仰齐 曹广力 何蕾 薛仁宇 贡成良 
国家自然科学基金项目(No.31072085);国家重大基础研究计划"973"项目(No.2012CB114600);江苏省研究生创新基金项目(No.CXZZ12_0823)
生物信息学分析结果显示家蚕质型多角体病毒（BmCPV）基因组s1片段中含有-个假定的重叠基因ORFX。为了检测该重叠基因ORFX是否在RNA和蛋白质水平有相应的表达产物，用大肠杆菌表达的重组ORFX蛋白制备多克隆抗体，对感染BmCPV的家蚕中肠...
关键词：家蚕质型多角体病毒 基因组S1片段 重叠基因 免疫组化 定量PCR 
人巨细胞病毒Merlin株全基因组的重叠基因结构与功能分析
《中华实验和临床病毒学杂志》2011年第3期194-196,共3页杨光 李月琴 邹奕 张欣 周天鸿 
国家自然科学基金（81041060）;中国博士后科学基金（20080430845）
目的 分析人巨细胞病毒（HCMV）merlin株全基因组存在ORF重叠的基因,揭示HCMV重叠基因的结构与功能特征.方法 应用生物信息学方法 搜索HCMV Merlin全基因组中的ORF重叠基因,分析HCMV merlin株重叠基因的编码序列CDS和ORF起止位点,计算CD...
关键词：巨细胞病毒 基因组 生物信息学 
高等真核生物中重叠基因研究
《太原师范学院学报（自然科学版）》2011年第2期147-151,共5页成亮 韩渊怀 李榆梅 张虹 
基因重叠是高等真核生物中一种普遍存在的基因组排现象.综述了高等真核生物中的重叠基因的分类、数量、互补或自然反义转录本(NATs)可能的生物特性和功能及重叠基因与人类疾病的关系.
关键词：真核生物 重叠基因 反义转录本 双链RNA(dsRNA) 基因调控 
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