基因组全序列

作品数：58被引量：216H指数：8
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侵染牡丹的苹果茎沟病毒分离物基因组测序及分析被引量：1
《园艺学报》2023年第12期2735-2747,共13页陈玲 郭铖 贾安宁 邓丛良 种焱 史喜菊 李永强 
“十四五”国家重点研发计划项目(2021YFF0703804)。
前期在北京地区种植的牡丹中检测到了苹果茎沟病毒(apple stem grooving virus,ASGV),并获得了1个ASGV牡丹分离物的基因组全序列。为分析侵染牡丹的ASGV的遗传多样性,根据已报道的118个ASGV基因组全序列的保守区设计特异性引物,用重叠(o...
关键词：苹果茎沟病毒 牡丹 基因组全序列 序列分析 重组 系统发育 
马铃薯Y病毒两个黑龙江烟草分离物的全基因组序列分析被引量：3
《中国烟草学报》2019年第3期67-75,共9页姜瀚林 程林发 姜鹏超 郭兆奎 刘永中 李向东 
黑龙江省烟草公司项目(HN201703);山东省烟草公司项目(KN238-201602);泰山学者建设工程(TS201712023)
为明确黑龙江烟区马铃薯 Y 病毒(Potato virus Y,PVY)分子株系和进化特征,从哈尔滨和牡丹江感病烟草采集到Harbin 和 MDJ 两个样品,通过 RT-PCR 扩增了其全基因组序列,并进行了一致率、重组、系统发育和选择压力等分析。结果表明,2 个...
关键词：马铃薯Y 病毒 基因组全序列 系统发育分析 重组分析 
3个黑龙江烟区烟草花叶病毒分离物的全基因组序列测定与分析被引量：6
《中国烟草学报》2019年第1期77-85,共9页姜瀚林 郭兆奎 刘永中 万秀清 刘文涛 李现道 李向东 
黑龙江省烟草公司项目(HN201703);山东省烟草公司项目(KN238-201602);泰山学者建设工程(TS201712023)
为明确黑龙江烟区烟草花叶病毒(Tobacco mosaic virus,TMV)分子株系和进化特征,从哈尔滨和牡丹江感病烟草采集到HEB1、HEB2和MDJ三个样品,通过RT-PCR扩增了其全基因组序列,并进行了一致率、重组、系统发育和选择压力等分析。结果表明,3...
关键词：烟草花叶病毒 基因组全序列 系统发育分析 重组分析 
线粒体DNA基因组全序列揭示克里雅人母系遗传结构被引量：3
《解剖学杂志》2018年第5期571-577,614,共8页刘树虎 王德萍 伊力哈木.乃扎木 多力坤.买买提玉素甫 
国家自然科学基金(31460285);中科院上海生命科学研究院计算生物学研究所重点实验室开放课题(2014KLCB02)
目的:探知克里雅人线粒体DNA(mtDNA)遗传结构和遗传多样性,构建人群mtDNA遗传数据库。方法:运用二代测序技术对70个来自达里雅布依的克里雅人mtDNA基因组全序列进行了测序和分型。结果:70个个体共检出变异位点256处,控制区变异位点71处...
关键词：克里雅人 线粒体DNA 隔离人群 单倍型 遗传结构 遗传多样性 
苹果茎痘病毒新疆阿克苏分离物基因组全序列测定及分析被引量：3
《植物保护学报》2018年第4期923-924,共2页龚卓群 郝璐 谢吉鹏 国立耘 周涛 
国家现代苹果产业技术体系(CARS-28);国家公益性行业(农业)科研专项(201203076-02)
苹果病毒病在世界各苹果种植地广泛发生,严重影响苹果生产。苹果茎痘病毒（Apple stem pitting virus,ASPV）是一种危害苹果的重要潜隐病毒,是凹陷病毒属Foveavirus的代表种（Adams et al.,2004）,基因组为正单链RNA,长约9 306 nt,编码...
关键词：苹果茎痘病毒 基因组 全序列测定 分离物 阿克苏 新疆 VIRUS 开放阅读框 
甘薯杆状DNA病毒B的分子检测及外壳蛋白CP基因的原核表达被引量：3
《植物保护学报》2016年第2期345-346,共2页李学成 张振臣 乔奇 秦艳红 王爽 郑文明 
国家现代农业(甘薯)产业技术体系(CARS-11-B-07)
甘薯杆状DNA病毒B（Sweetpotato badnavirus B,SPBV-B）是花椰菜花叶病毒科杆状DNA病毒属Badnavirus的一个暂定种。Badnavirus病毒粒体为杆状,主要分布在热带和亚热带地区,由带毒寄主植物的无性繁殖材料传播,传毒昆虫介体主要是粉蚧（...
关键词：DNA病毒B CP基因 基因组全序列 外壳蛋白 原核表达 寄主植物 粉蚧 测序法 核苷酸序列 分子检测 
汉坦病毒西安分离株基因组全序列测定及分析被引量：2
《陕西医学杂志》2013年第12期1581-1582,1585,共3页吴瑞 余鹏博 李静 杜全丽 陈海龙 刘继锋 李恒新 马超锋 
陕西省科技计划项目(2011JM4010)
目的:测定分离自西安地区黑线姬鼠携带的的汉滩病毒毒株XAAa10091712全基因组序列,对各片段进行进化分析。方法:设计各片段引物,采用反转录-聚合酶链反应,分节段扩增各基因片段,直接用PCR产物或克隆入pMD18-T载体后进行测序分析。结果:...
关键词：汉滩病毒 @西安分离株 基因组 序列分析 
广东省流行的3株登革热2型病毒基因组全序列测定及分析被引量：6
《中国媒介生物学及控制杂志》2013年第5期392-396,共5页白志军 张培 洪文艳 刘建伟 狄飚 杨智聪 任瑞文 方美玉 林立辉 
美国国立卫生研究院项目(1R01AI083202-01A1);国家科技重大专项(2012ZX10004-213-005);广东省科技计划项目(2011B031500011);广州市科技计划项目(2010Y1-C151;2012Y2-00020);广州市医药卫生科技项目(201102A212006;20121A011122)~~
目的测定广东省3株登革热2型病毒的全序列,探讨其来源及基因型。方法运用RT PCR法扩增来自广东省的登革热2型GD09/93、GD05/98和GD19/2001病毒株的全序列,采用遗传距离法构建进化树。结果3株登革热2型病毒的全基因组长度均为10 723 nt,...
关键词：登革热病毒 全序列 系统发生树 基因型 聚合酶链反应 
烟草PVYN辽宁分离物全序列测定与分析被引量：2
《中国烟草学报》2013年第4期109-113,共5页王芳 高正良 周本国 许大凤 安梦楠 吴元华 
辽宁省烟草公司科技攻关项目(辽烟计(2010)86号);安徽省烟草公司科技攻关项目(项目编号:20100551005)
利用引起烟草脉坏死病的马铃薯Y病毒脉坏死株系辽宁分离物(Potato virus Y—vein necrosis strain Liaoning isolate,PVYN-LN),以GenBank中已有的PVY全序列为基础,设计特异引物。通过总RNA提取、RT-PCR、3’RACE和5’RACE扩增及序列测定...
关键词：烟草 PVYN 基因组全序列 重组分析 
基于叶绿体基因组全序列分析真叶植物叶绿体基因的适应性进化被引量：10
《中山大学学报（自然科学版）》2012年第3期108-113,146,共7页王博 高磊 苏应娟 王艇 
国家自然科学基金资助项目(30970290;31070594)
真叶植物包括蕨类、裸子植物和被子植物。迄今已积累有较为丰富的真叶植物叶绿体基因组全序列数据。选取了29种真叶植物的叶绿体基因组全序列,采用PAML软件基于位点间可变ω模型,分别分析了蕨类、裸子植物和被子植物叶绿体基因的适应性...
关键词：真叶植物 叶绿体基因 叶绿体基因组全序列 正选择 
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