正选择

作品数:88被引量:185H指数:8
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鲽形目鱼类Hoxd12a基因适应性进化及其在半滑舌鳎中的组织表达分析
《海洋与湖沼》2025年第1期226-235,共10页汪凯欣 张楠楠 吴文超 吕文拯 刘立芹 吕振明 龚理 
浙江省自然科学基金资助,LMS25C190002号;浙江省属高校基本科研业务费项目资助,2024J005-2号。
Hox基因家族在后生动物身体前后轴的形成过程中发挥至关重要的调控作用,其中Hoxd12a基因已被证实与鱼类胸鳍和四足动物四肢发育密切相关。鲽形目鱼类胸鳍普遍短小甚至缺失等现象是鱼形动物进化史上显著的形态创新,然而该形态创新背后的...
关键词:鲆鲽类 HOX基因 正选择 表达模式 
鲸偶蹄目RNase11和RNase12的分子进化研究
《安徽大学学报(自然科学版)》2024年第1期72-84,共13页郎大田 李高银 张毅 刘松菊 
云南省地方本科高校基础研究联合专项资金面上项目(202101BA070001-068);云南省科技特派员项目(202104BK090932);云南省中青年学术和技术带头人后备人才项目。
脊椎动物特有的RNaseA超家族因频繁发生基因重复和功能分化,一直被认为是分子进化研究的经典模型.过去研究主要聚焦于RNaseA超家族中与食性相关的典型成员RNase1,而非典型成员的研究非常有限.笔者以鲸偶蹄目4个亚目21科92个物种为研究对...
关键词:鲸偶蹄目 RNase11 RNase12 正选择 分子进化 
民猪从头组装(de novo)的基因组序列特征分析
《吉林农业大学学报》2023年第5期600-608,共9页张冬杰 何鑫淼 汪亮 刘娣 
财政部和农业农村部“国家现代农业产业技术体系”项目(CARS-35);黑龙江省科研业务费资助项目(CZKYF2020A004)。
利用Hiseq 2000测序平台对1头雌性民猪采用从头组装(de novo)策略,绘制了其完整的基因组序列。测序深度达116.91×,N50 contig为57.3 kb,N50 scaffold为4.91 Mb,最终组装的基因组大小为2.64 Gb。组装的基因组中重复序列共占基因组大小的...
关键词:民猪 从头组装策略 全基因组测序 遗传变异 正选择 
深海囊螂蛤铁蛋白的环境选择压力分析
《海洋通报》2023年第5期533-544,共12页孔雪 王玮 蔡月凤 李亚男 张驰乐 张海滨 申欣 
江苏省自然科学基金杰出青年基金(BK20190048);江苏省自然科学基金青年基金(BK20210927);江苏省高等学校基础科学(自然科学)研究面上省资助经费项目(21KJB170022);江苏省海洋生物资源与环境重点实验室开放课题(SH20201208);江苏海洋大学人才引进科研基金项目(KQ19043);江苏高校优势学科建设工程资助项目。
深海环境常有高压、极端温度、富含重金属、黑暗、寡营养等特点。生活在该种特殊环境中的生物可能演绎出不同机制适应此生境。囊螂科贝类是深海冷泉/热液区的优势物种,拟通过对来自冷泉/热液区囊螂科贝类铁蛋白进行环境选择压力分析,以...
关键词:铁蛋白 冷泉热液区 正选择 囊螂蛤 
鸡TLR1A基因正选择nsSNP与沙门氏菌易感性的关联性研究被引量:2
《中国畜牧杂志》2023年第5期136-142,共7页孟婕 张传生 张夕霏 周泽宇 张贝 李可 李祥龙 耿立英 
河北省鸡现代种业科技创新团队优质特色燕山红玉肉鸡种质创制(21326303D-5);河北省现代农业产业技术体系蛋肉鸡创新团队遗传资源开发与利用岗位专家项目;(HBCT 2018150201);省属高校基本科研业务费优秀创新团队建设项目(2021JK15)。
为探究鸡TLR1A基因正选择nsSNP位点与沙门氏菌易感性的关联,挖掘其潜在的功能性位点,本研究利用多种生物信息学方法对ChTLR1A的21个nsSNP位点及基因的选择压力进行综合分析,筛选ChTLR1A正选择nsSNP功能性位点,深入分析其与鸡沙门氏菌易...
关键词:TLR1A nsSNP 沙门氏菌 dCAPS 正选择 
海洋哺乳动物尿素转运蛋白关键基因——SLC14A2的分子进化
《南京师大学报(自然科学版)》2022年第3期79-86,共8页曾帆 吴田振 于振朋 孙林霞 郭天慧 
江苏省种业振兴“揭榜挂帅”项目(JBGS[2021]034);江苏省农业重大新品种创制项目(PZC201744)。
趋同进化是进化生物学中的核心科学问题.独立起源的海洋哺乳动物不同类群为了适应高渗的海洋环境,产生了趋同的渗透调节适应机制,能够产生高度浓缩的尿液.本研究选取了编码尿素转运蛋白的SLC14A2基因为候选基因,进化分析发现该基因在海...
关键词:海洋哺乳动物 渗透调节 SLC14A2基因 正选择 
百合属5种植物的比较转录组分析被引量:2
《植物研究》2021年第4期614-625,共12页赵雪艳 李思锋 柏国清 李为民 
陕西省重点研发计划项目—农业领域(2018NY-88);陕西省科学院科技计划项目(2020K-28)。
百合属植物是多年生的宿根草本植物,具有重要的观赏价值,有的种可食用也可药用。本研究对百合属4种植物(细叶百合、川百合、卷丹和百合)花的转录组进行测序,并结合前期的野百合的转录组数据进行比较转录组分析,鉴别花发育相关基因。并...
关键词:百合属 转录组 花发育基因 直系同源基因 正选择基因 
小麦RCAR基因家族的鉴定、进化与逆境响应
《中国农业科技导报》2020年第8期14-24,共11页史梦梦 温思钰 赵佳佳 乔玲 武棒棒 郑兴卫 郑军 
山西省重点研发项目(201703D211007,201803D4210);山西省农科院项目(17yzgc010)。
研究小麦RCAR基因家族的进化与逆境响应,有助于阐明RCAR基因抵御逆境胁迫的调控机制。根据保守结构域在小麦基因组中鉴定出27个RCARs,除了第5和6同源群外,其余同源群均有分布。根据进化关系可分为6个亚组;GroupA和GroupB中12个TaRCARs...
关键词:小麦 RCAR基因家族 正选择 进化分析 逆境响应 
草地贪夜蛾与斜纹夜蛾嗅觉味觉相关基因的比较分析被引量:7
《环境昆虫学报》2019年第5期937-946,共10页黄钧鸿 张铭淇 冯启理 崔勇 相辉 
草地贪夜蛾 Spodoptera frugiperda,近期侵入中国并迅速扩张。与其近缘物种斜纹夜蛾Spodoptera litura 不同,草地贪夜蛾主要偏好玉米、水稻、小麦等禾本科农作物,暴食危害重。此外两种害虫在交配、产卵频率等繁殖特征上也存在差异。这...
关键词:草地贪夜蛾 斜纹夜蛾 嗅觉相关蛋白 气味分子结合蛋白 味觉受体 正选择 
SXT/R391元件核心基因的生物信息学分析
《生物技术通讯》2019年第5期597-603,共7页张琪 周静 周江林 孔娜 胡明达 彭小川 李北平 梁龙 靳远 任洪广 岳俊杰 
国家自然科学基金(31671363,31801096);国家科技重大专项(2018ZX10101003-001-008);北京市自然科学基金(7162146)
目的:SXT/R391元件是革兰阴性菌中研究最充分、已知成员最多的整合性接合元件家族,本研究的主要目的是探讨SXT/R391元件核心基因组的适应性进化规律。方法:收集数据库中及文献报道的SXT/R391家族元件数据,并利用已测序的细菌基因组序列...
关键词:SXT/R391元件 重组分析 正选择分析 
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