张传生

作品数:86被引量:399H指数:10
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供职机构:河北科技师范学院动物科技学院更多>>
发文主题:生物信息学分析MICRORNAMYOG基因单核苷酸多态性生物信息学更多>>
发文领域:农业科学生物学文化科学医药卫生更多>>
发文期刊:《山东农业科学》《生物多样性》《浙江农业科学》《河南农业科学》更多>>
所获基金:国家现代农业产业技术体系建设项目河北省自然科学基金博士科研启动基金国家科技支撑计划更多>>
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基于转录组测序技术鉴别影响莱芜猪滴水损失的关键基因
《畜牧兽医学报》2025年第3期1134-1146,共13页贾万里 王继英 李菁璇 王彦平 耿立英 张传生 赵雪艳 
山东省重点研发计划(2022LZGCQY007,2022LZGC003);山东省生猪产业技术体系(SDAIT-08-03);山东省自然科学基金(ZR2024MC064)。
旨在筛选影响莱芜猪滴水损失的关键基因,以提高猪肉质品质并减少滴水带来的经济损失。本研究选取胴体重为(72.30±1.26)kg的28头莱芜猪(公猪19头,母猪9头),测定48 h滴水损失、肉色、肌内脂肪含量和pH等肉质性状,并进行背最长肌组织的转...
关键词:莱芜猪 滴水损失 RNA测序 肉质性状 候选基因 
基于全基因组重测序分析坝上长尾鸡遗传多样性与保种效果
《中国畜牧杂志》2024年第11期120-126,共7页张夕霏 葛华梁 赵然 钱治民 任敏鹏 王彩彤 张传生 耿立英 李祥龙 
河北省鸡现代种业科技创新团队优质特色燕山红玉肉鸡种质创制(21326303D-5);河北省现代农业产业技术体系蛋肉鸡创新团队遗传资源开发与利用岗位专家项目(HBCT2018150201);省属高校基本科研业务费优秀创新团队建设项目(2021JK15)。
本研究旨在通过全基因组重测序技术分析坝上长尾鸡群体遗传多样性,评估其保种效果,以更好地保护和利用该遗传资源。研究采用基因组全测序技术检测37只坝上长尾鸡和40只巴布考克B380的基因组变异,通过群体遗传多样性、连续纯合子片段(Run...
关键词:坝上长尾鸡 全基因组重测序 遗传多样性 
鸡松果体昼夜节律基因表达的RNA测序分析
《河北科技师范学院学报》2024年第3期28-36,共9页葛华梁 张夕霏 任敏鹏 马怡梦 赵然 张传生 耿立英 李祥龙 
河北省省属高校基本科研业务费专项项目(项目编号:2021JK15);河北省鸡现代种业科技创新团队优质特色燕山红玉肉鸡种质创制(项目编号:21326303D-5);河北省现代农业产业技术体系蛋肉鸡创新团队遗传资源开发与利用岗位专家项目(项目编号:HBCT2018150201)。
本次研究旨在探索白莱航鸡松果体基因在昼夜节律调控中的表达特征及其生物学意义。研究选取了在12 h光照/12 h黑暗周期中饲养的白莱航鸡,并在第10 d 24 h黑暗的情况下每隔4 h取样一次,获得其松果体基因表达的时间序列数据。利用R语言筛...
关键词: 松果体 昼夜节律 加权基因共表达网络分析 
鸡TLR1A基因2个SNP位点功能分析及与坝上长尾鸡沙门氏菌感染抗性的相关分析
《河北科技师范学院学报》2023年第4期59-66,共8页张夕霏 孟婕 周泽宇 葛华梁 贾万里 张传生 耿立英 
河北省省属高校基本科研业务费专项项目(项目编号:2021JK15);河北省鸡现代种业科技创新团队优质特色燕山红玉肉鸡种质创制(项目编号:21326303D-5);河北省现代农业产业技术体系蛋肉鸡创新团队遗传资源开发与利用岗位专家项目(项目编号:HBCT2018150201)。
为确定鸡TLR1A基因g.926G>A和g.1076G>C等2个nsSNP位点多态性及其功能意义,采用CRS-PCR-RFLP方法检测了310只坝上长尾鸡(阳性127只,阴性183只)TLR1A基因2个nsSNP位点的多态性、二者与沙门氏菌抗性的关联,并对其进行生物信息学与适应性...
关键词: TLR1A nsSNP 沙门氏菌 生物信息学分析 
MC1R基因多态性与杜黑猪毛色关系研究
《山东农业科学》2023年第10期152-157,共6页巩静 杨晴 王艺盼 王彦平 朱晓东 张传生 耿立英 王继英 
山东省农业良种工程项目(2020LZGC012,2022LZGCQY007);枣庄市自主创新及成果转化项目(2022GH-27);山东省生猪产业技术体系(SDAIT-08-03)。
黑色素皮质素受体1(MC1R)基因是调控哺乳动物毛色的一个关键基因。为了解杜洛克和枣庄黑盖猪杂交组合(简称杜黑猪)中MC1R基因多态性与毛色表型的关系,本研究以390头杜黑猪F_(2)代个体和18头枣庄纯种黑盖猪为研究对象,对F_(2)代群体进行...
关键词:杜黑猪 毛色 MC1R基因 SNP 基因型 
芯片和重测序在猪遗传结构研究中的应用比较被引量:4
《畜牧兽医学报》2023年第7期2772-2782,共11页杨晴 巩静 赵雪艳 朱晓东 耿立英 张传生 王继英 
山东省农业良种工程项目(2020LZGC012;2022LZGCQY007);山东省生猪产业技术体系(SDAIT-08-03);枣庄市自主创新及成果转化项目(2022GH-27);国家生猪产业技术体系(CARS-35)。
旨在比较芯片与测序SNP分型技术、标记密度对遗传多样性、系统发生树和近交系数等分析结果的影响,探讨遗传结构分析中低成本、高效的分型方法和适宜的SNP密度。本研究以35头枣庄黑盖猪的CAUPorcineSNP50芯片数据和重测序数据为基础,以...
关键词:SNP芯片 重测序 遗传多样性 系统进化树 基因组近交系数 
鸡TLR1A基因正选择nsSNP与沙门氏菌易感性的关联性研究被引量:2
《中国畜牧杂志》2023年第5期136-142,共7页孟婕 张传生 张夕霏 周泽宇 张贝 李可 李祥龙 耿立英 
河北省鸡现代种业科技创新团队优质特色燕山红玉肉鸡种质创制(21326303D-5);河北省现代农业产业技术体系蛋肉鸡创新团队遗传资源开发与利用岗位专家项目;(HBCT 2018150201);省属高校基本科研业务费优秀创新团队建设项目(2021JK15)。
为探究鸡TLR1A基因正选择nsSNP位点与沙门氏菌易感性的关联,挖掘其潜在的功能性位点,本研究利用多种生物信息学方法对ChTLR1A的21个nsSNP位点及基因的选择压力进行综合分析,筛选ChTLR1A正选择nsSNP功能性位点,深入分析其与鸡沙门氏菌易...
关键词:TLR1A nsSNP 沙门氏菌 dCAPS 正选择 
鸡IFITM/IFIT基因家族中与抗禽流感病毒相关的关键基因挖掘
《河北科技师范学院学报》2022年第4期32-38,71,共8页张夕霏 张贝 周泽宇 孟婕 耿立英 张传生 李祥龙 
河北省省属高校基本科研业务费专项项目(项目编号:2021JK15);河北省鸡现代种业科技创新团队优质特色燕山红玉肉鸡种质创制(项目编号:21326303D-5);河北省现代农业产业技术体系蛋肉鸡创新团队遗传资源开发与利用岗位专家项目(项目编号:HBCT2018150201)。
为深入了解分析鸡IFITM/IFIT基因家族的特性,以禽流感病毒攻毒后的鸡RNA-seq数据为研究对象,通过加权基因共表达网络分析,构建了鸡的肺组织对不同亚型禽流感免疫反应的加权基因共表达网络,并对其模块进行了性状关联性分析与功能富集分析...
关键词: IFITM/IFIT基因家族 加权基因共表达网络分析 
调控鸡黑色素生成相关基因共表达网络的构建被引量:1
《河北科技师范学院学报》2022年第4期39-46,共8页周泽宇 张夕霏 孟婕 张传生 李祥龙 耿立英 
河北省鸡现代种业科技创新团队优质特色燕山红玉肉鸡种质创制(项目编号:21326303D-5);河北省现代农业产业技术体系蛋肉鸡创新团队遗传资源开发与利用岗位专家项目;(项目编号:HBCT2018150201);省属高校基本科研业务费优秀创新团队建设项目(项目编号:2021JK15)。
为了挖掘与鸡黑色素生成有关的基因,研究通过对NCBI网站公布的12份惠阳髯毛鸡羽毛毛囊的转录组数据进行了基因差异表达分析,并结合黑色素生成相关通路中的基因构建了共表达网络。结果显示:共筛选出了74个差异基因和100个通路基因用于权...
关键词: 黑色素 WGCNA hub基因 
鸡IFITM3基因编码区克隆及生物信息学分析
《中国畜牧杂志》2022年第10期223-229,234,共8页张贝 孟婕 周泽宇 张夕霏 张传生 耿立英 李祥龙 
河北省鸡现代种业科技创新团队优质特色燕山红玉肉鸡种质创制(21326303D-5);河北省现代农业产业技术体系蛋肉鸡创新团队遗传资源开发与利用岗位专家项目(HBCT2018150201);河北省教育厅重点项目(ZD2018034);秦皇岛市科学技术研究与发展计划(201903B001)。
为探究鸡IFITM(Interferon-Induced Transmembrane,IFITM)3基因SNPs(Single Nucleotide Polym orphisms,SNPs)位点的多态性,挖掘其潜在的功能性位点,本研究对鸡IFITM3基因编码区进行克隆,结合多种生物信息学方法对蛋白nsSNPs(nonsense-S...
关键词: IFITM3 多态性分析 错义SNP分析 选择压力分析 
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