基因差异

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转录组测序与定量蛋白质组学分析医用臭氧治疗兔骨骼肌损伤的分子机制
《中国组织工程研究》2025年第18期3767-3774,共8页阮珍 寇久社 
陕西省科技计划项目(2019JM-483)项目负责人:寇久社。
背景:医用臭氧局部注射作为一种新的治疗方法,对损伤的骨骼肌组织具有抗炎、镇痛及免疫调节等作用,但其作用机制尚缺乏系统的研究。目的:观察医用臭氧对兔骨骼肌挤压伤模型的干预效应,通过转录组测序与标记定量蛋白技术分析损伤的兔胫...
关键词:骨骼肌损伤 医用臭氧 转录组测序 蛋白质组学 基因差异表达 
基于差异共表达邻接网络的癌症致病基因预测算法
《计算机科学》2025年第5期161-170,共10页李志杰 廖旭红 李青蓝 刘丽 
国家自然科学基金(62072475,61672391);湖南省自然科学基金(2019JJ40111)。
癌症是人类健康的第一杀手。随着测序技术的快速发展,积累了海量的癌症基因表达数据,利用计算方法进行致病基因预测成为癌症研究领域新的热点。然而,目前致病基因预测大多基于基因相互作用网络等,很少考虑网络局部连接与基因差异表达间...
关键词:基因差异表达数据 邻接网络 候选基因 基因特征向量 癌症致病基因预测 
外源硒、碘对水稻剑叶基因差异表达及相关通路的影响
《江西农业学报》2025年第4期1-10,共10页魏杰 杜小凤 李长成 贾义乐 陈紫岩 张豪杰 尹航 梁双林 吴传万 章安康 
江苏省农业重大技术协同推广计划项目(2024-ZYXT-07);淮安市自然科学研究计划项目(HAB202170);淮安市科技项目(HAB202375);淮安市农科院科研发展基金项目(HNY202215)。
以南粳9108为试验材料,于水稻灌浆期在叶面喷施氨糖硒(Se)和氨糖碘(I),并以喷施清水作为对照(CK),处理后10 d取水稻剑叶用于转录组测序分析。结果表明:氨糖硒和氨糖碘处理下分别获得差异表达基因270和292个,其中共同检测到的差异表达基...
关键词:水稻 氨糖硒 氨糖碘 基因差异表达 转录组 
桔梗白花和紫花发育过程基因差异表达研究
《作物杂志》2025年第2期54-65,共12页齐书娅 严一字 金卓 吴松权 
吉林省科技厅重点研发项目“高品质道地药材桔梗的生态种植技术集成”(20220204048YY)。
为挖掘影响桔梗紫花花色形成基因和途径,利用百迈客云平台BMKCloud对桔梗白花和紫花3个时期(花蕾期、转色期、开放期)进行了转录组测序,筛选桔梗花青素代谢相关差异表达基因。筛选到5个KEGG通路与花青素代谢相关。本试验共筛选出11个参...
关键词:转录组 花青素 桔梗 花色 差异表达基因 
白麻NAC基因家族全基因组鉴定及其干旱胁迫下表达分析
《干旱地区农业研究》2025年第2期54-65,共12页谢文龙 王彦芹 
新疆维吾尔自治区南疆重点产业创新发展支撑计划项目(2022DB012);新疆生产建设兵团第一师农业农村局农业领域项目(2023ZD04040-4-2)。
基于白麻基因组数据,在白麻全基因组范围内鉴定了53个NAC基因家族成员,并对其染色体分布、系统发育、基因和蛋白结构、蛋白理化性质与功能、顺式作用元件进行预测分析,并结合干旱胁迫下的转录组数据分析NAC基因的表达。结果显示,白麻的A...
关键词:白麻 NAC基因家族 干旱胁迫 基因差异表达 
‘宁杞1号’响应NaCl胁迫相关基因的差异表达分析
《生物技术通报》2025年第2期202-209,共8页李晶晶 胡进红 梁旺利 麻玉荣 梁文裕 王玲霞 
宁夏自然科学基金项目(2023AAC05024,2024AAC03097);国家自然科学基金项目(32301632)。
【目的】探究盐胁迫下‘宁杞1号’(Lycium barbarum Ningqi 1)信号转导途径相关基因差异表达规律,为深入解析‘宁杞1号’耐盐碱的分子机理奠定基础。【方法】基于转录组测序技术,对不同浓度NaCl胁迫下‘宁杞1号’叶片信号转导途径相关...
关键词:宁杞1号 NACL胁迫 信号转导 基因差异表达 
基于生物信息学分析对结直肠癌与不同距离癌旁组织的基因差异表达的探讨
《包头医学院学报》2025年第1期1-8,共8页刘国芳 郑连生 汤泊夫 邵国 
国家自然科学基金项目(82060337);深圳市龙岗区医疗卫生科技计划项目(LGKCYLWS2021000033,LGKCYLWS2023025);深圳市科技计划计划项目基础研究面上项目(JCYJ20220531092412028,JCJY20230807121306012)。
目的:通过生物信息学分析,探讨结直肠癌与不同距离癌旁组织中的基因差异表达的机制。方法:通过Illumina Novaseq 6000测序平台对所选标本进行真核mRNA测序。结果:表达量差异分析显示,在结直肠癌上缘组中差异表达基因共28000个,其中上缘...
关键词:生物信息分析 结直肠癌 差异基因 
大鼠孕期暴露DBP对子代睾丸mRNA差异表达的影响
《北华大学学报(自然科学版)》2024年第6期795-800,共6页孙秀玲 冯馨阅 刘闵慧 于佳鑫 王洪艳 李环 
吉林省卫生健康科技能力提升项目(2021JC080);吉林省科技发展计划项目(20210203187SF);吉林省教育厅科学技术研究项目(JJKH20200075KJ);吉林省大学生创新创业项目(202110201055)。
目的探讨大鼠孕期暴露DBP对子代睾丸mRNA差异表达的影响。方法选取清洁级SD成年鼠,雌雄比例12交配,确定怀孕后行DBP染毒,试验组灌胃剂量为500 mg/kg,同时设置对照组,每组8只;试验组老鼠染毒至哺乳期结束,饲养子代雄鼠60 d,解剖取睾丸组...
关键词:邻苯二甲酸二丁酯(DBP) MRNA 睾丸 基因差异表达 
马铃薯早疫病病原菌Alternaria solani侵染‘合作88’不同时期转录组分析
《植物病理学报》2024年第6期1091-1102,共12页李清 侯晓雪 张向东 王荣艳 唐唯 李灿辉 
四倍体马铃薯优良品种重要农业性状遗传解析;云南省基础研究重点项目(202301AS070010);云南师范大学2023年度研究生科研创新基金(YJSJJ23-B156)。
马铃薯早疫病(Potato Early Blight, PEB)是马铃薯生长期叶部重要病害,在世界范围内马铃薯各主产区普遍发生,目前没有特效防治药剂或完全抗性的马铃薯品种。本实验利用马铃薯早疫病病原菌Alternaria solani接种云南省主栽品种‘合作88’...
关键词:马铃薯早疫病 Alternaria solani ‘合作88’ 转录组 基因差异表达 
柳枝稷生长、生理和基因差异表达对供磷水平的响应
《植物营养与肥料学报》2024年第11期2181-2196,共16页刘威帆 赵匆 吴娜 刘吉利 
国家自然科学基金项目(31860344);宁夏自然科学基金项目(2022AAC03062)。
【目的】探究柳枝稷(Panicum virgatum L.)在不同磷水平下的生理代谢及转录水平变化,以解析柳枝稷磷响应特征,挖掘磷高效利用基因。【方法】以‘Pathfinder’品种柳枝稷为供试材料,采用水培方法(Hoagland营养液)进行培养试验。营养液设...
关键词:供磷水平 柳枝稷 生理指标 转录组 糖酵解 苯丙素生物合成 磷吸收转运 
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