高血压相关基因和蛋白质数据库的初构  被引量:4

The preliminary construction of the database of hypertension related genes and proteins

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作  者:张其鹏[1] 张丹[1] 刘贝[1] 朱晓华[1] 卢铭[1] 陈光慧[1] 尚彤[1] 汤建[1] 

机构地区:[1]北京大学心血管研究中心,北京100083

出  处:《北京大学学报(医学版)》2002年第2期178-183,共6页Journal of Peking University:Health Sciences

基  金:国家重点基础研究发展规划项目基金 (G2 0 0 0 0 5 6 90 7)~~

摘  要:目的 :构建高血压相关基因和蛋白质数据库 ,以促进高血压医学生物信息学的研究。方法 :以GenBank、LocusLink、GDB、GenCard、Proteome等数据库作为信息数据来源 ;根据高血压相关信息的内容将数据库设计为基因、蛋白质和功能 3部分 ;编写软件从上述信息资源中获取数据 ,分类整理 ,存入数据库 ,利用软件的管理和查询功能对于本地数据进行管理和检索。结果 :经过OMIM、文献和相关数据库的检索 ,目前确定了 431个高血压的相关基因 ,379个蛋白质 ;建立高血压相关基因和蛋白质数据库 ,并对其内容进行初步分析。最终实现了网上发布和查询。结论 :通过整合现有相关信息 ,建立一个种类繁多、内容齐全与高血压相关的二级数据库 ,为高血压和心血管的研究提供一个新的便捷的生物信息查询的工具。Objective: To constract hypertension Related Gene and Protein Database and provide a useful query tool for the research of hypertension in biomedical information. Methods: Data are collected from databases such as GenBank, LocusLink, GDB, GenCard, and Proteome. And items of the database are divided into 3 aspects: gene, protein and function. Data were classified, and stored into database by programming and published on web. Results:We found 431 genes and 379 proteins to relate to hypertension from OMIM, related articles and databases. And the contents of database were also analyzed. Conclusion: A complete and content rich database related to hypertension has been constructed, providing a new and useful bioinformatics query tool for hypertension and cardiovascular research.

关 键 词:高血压 基因 蛋白质数据库 生物信息学 

分 类 号:R544.1[医药卫生—心血管疾病]

 

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