口蹄疫病毒China/99基因组RNA序列测定及比较分析  

作　　者：张显升[1] 刘在新[1] 赵启组[1] 常惠芸[1] 谢庆阁[1] 

机构地区：[1]中国农业科学院兰州兽医研究所病毒室,兰州730046

出　　处：《中国科学（C辑）》2003年第5期461-467,共7页Science in China(Series C)

基　　金：国家"973"资助项目(批准号:G1999011901)

摘　　要：测定了1999年我国口蹄疫流行毒株(China/99,Tibet)基因组全序列,China/99基因组RNA全长8173个核苷酸(nt),开放阅读框含盖6999nt,编码2332个氨基酸的聚合蛋白。5’和3’非翻译区(UTR)分别长1081和93nt.China/99与12株参考株基因组序列比较发现:China/99与英国2001年流行毒、海南和西藏1999年流行毒Id基因的序列同源性高达97％以上,均属泛亚毒株;在牛和猪FMDV的功能未知区、p2和p3区存在较为显著的核苷酸序列差异,3a基因最为显著;l,1a,1b,2a,2c,3b和3d基因没有核苷酸缺失或插入现象,属于病毒必需基因;口蹄疫病毒S片段、功能未知区和内部核糖体进入位点(IRES)二级结构均可分为3种类型。S片段和3’UTR折叠成一个三叶草类似结构。

关 键 词：口蹄疫病毒 China/99基因组 RNA序列测定 比较分析 核苷酸 氨基酸 二级结构 

分 类 号：S852.65[农业科学—基础兽医学]