自组织神经网络算法在低氧大鼠脑细胞凋亡相关基因表达谱分析中的应用  

The Application of Self-Organizing Maps Algorithm in the Expression Analysis of Hypoxic Rat Cerebral Apoptosis

作　　者：周厚清[1] 刘刊[2] 马子敏[3] 吴立颍[3] 赵彤[3] 聂洪靖[4] 谢印芝[4] 

机构地区：[1]深圳市第二人民医院,深圳518036 [2]上海第二军医大学海医系 [3]北京军事医学科学院基础医学研究所 [4]天津军事医学科学院卫生学环境医学研究所

出　　处：《数理医药学杂志》2004年第2期118-121,共4页Journal of Mathematical Medicine

基　　金：国家自然科学基金资助项目 (399790 90 8)

摘　　要：运用自组织神经网络算法分析复方党参对模拟高原低氧条件下大鼠脑神经细胞凋亡基因表达谱的作用 ,从中药与生物体基因网络相互作用的角度 ,探讨了复方党参的作用机制。将 Wistar大鼠置于模拟海拔 70 0 0 m的低压氧舱建立高原低氧大鼠脑细胞凋亡模型 ,于上舱前 7d开始灌复方党参液。提取空白对照组、低氧 8d对照组、常氧复方党参组及低氧 8d复方党参组大鼠脑组织总RNA,经逆转录合成 c DNA探针 ,用 [α-32 P]标记探针 ,各自与 Atlas c DNA Array膜杂交 ,经严格的冲洗后用磷屏检测 c DNA表达水平。获得的基因表达谱数据集采用自组织神经网络算法 (SOMs)分析。结果显示 ,低氧可以启动细胞凋亡的线粒体途径 ,导致细胞死亡 ;而复方党参以凋亡相关基因网络中的多种成分为靶点 ,从不同层次上发挥抑制细胞凋亡的作用。

关 键 词：自组织神经网络算法 低氧 大鼠 脑细胞 基因表达谱 细胞凋亡 微阵列 中药 复方党参片 

分 类 号：R364.4[医药卫生—病理学] R285.5[医药卫生—基础医学]