一个鼻咽癌家系中存在COX7B2基因的低频变异  

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作  者:梁慧[1] 陈汉奎[1] 沈亚云 冯启胜[1] 金玮 黄薇 曾益新[1] 

机构地区:[1]中山大学肿瘤医院实验研究部,广州510060 [2]国家人类基因组南方研究中心遗传部,上海201203

出  处:《中国科学(C辑)》2004年第3期252-256,共5页Science in China(Series C)

基  金:国家科技攻关项目(批准号: 2002BA711A03; 2002BA711A10);广东省重大科技专项计划项目(批准号: A1080202)

摘  要:在中国南方鼻咽癌(nasopharyngealcarcinoma,NPC)高发地区,遗传易感性在鼻咽癌发病中起重要作用,在4p11-4p14区域存在一个鼻咽癌易感位点.采用PCR-直接测序法对位于该区域内的细胞色素C氧化酶亚单位Ⅶb2(COX7B2)基因进行单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphism,SNP)筛查,对发现的变异在家系患者、散发病例和正常人群中进行分型分析,探讨COX7B2基因变异是否与鼻咽癌有关.在COX7B2基因中共发现5个新的SNP位点,分别位于上游启动子区(-158101G>T和-157322G>A)、第2内含子区域(-109602A>G)、第3外显子区(78T>A)和3-非翻译区(354T>A).位于第3外显子编码区的78T>A变异导致CAT26CAA(His26Gln)改变,在31号鼻咽癌家系中与患者易感单体连锁,但不存在于其他家系患者和散发病人中.在广东地区和华东地区对照个体中78T>A变异的频率分别为0.45%(2/448)和0.26%(1/384),在白人、黑人样本中没有发现该变异.蛋白质序列比对显示COX7B2亚基26His位点在人、大猩猩、黑猩猩、长臂猿、大鼠和小鼠中十分保守.上述结果提示COX7B2基因26His是一个保守的位点,低频的His26Gln变异可能与31号家系的鼻咽癌高发有关.

关 键 词:COX782基因 鼻咽肿瘤 单核苷酸多态性 低频变异 保守性 易感单体连锁 

分 类 号:R739.63[医药卫生—肿瘤]

 

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