黑龙江省杰出青年科学基金(JC200808)

作品数:4被引量:3H指数:1
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相关作者:郭政姚晨李红东赵文媛王靖更多>>
相关机构:电子科技大学哈尔滨医科大学成都医学院更多>>
相关期刊:《生物物理学报》《生物信息学》《数理医药学杂志》更多>>
相关主题:GENE_ONTOLOGYGENEDNA甲基化肺腺癌基因表达改变更多>>
相关领域:生物学医药卫生更多>>
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基于基因差异表达的微弱信号识别疾病相关功能
《生物物理学报》2012年第3期232-241,共10页邹金凤 郝春香 何浪 郭政 
国家自然科学基金项目(30970668;31100901;81071646;91029717);黑龙江省杰出青年基金项目(JC200808)~~
当两组样本间基因表达的差异程度较低或样本量较少时,采用通常的错误发现率(falsediscovery rate,FDR)控制水平(如5%或10%),可能无法识别足够多的差异表达基因以进行后续的功能富集分析。然而,功能富集分析对差异表达基因中的错误发现...
关键词:乳腺癌 转移 统计效能 差异表达基因 功能 
基于Gene Ontology功能体系分析肺腺癌相关功能的共扰动机制被引量:1
《生物物理学报》2011年第11期963-974,共12页王靖 周贤孝 朱晶 赵文媛 顾云燕 郭政 
国家自然科学基金项目(91029717;30970668;81071646);黑龙江省杰出青年基金项目(JC200808);黑龙江省自然科学基金项目(QC2010012);黑龙江省教育厅科研基金项目(11541156)~~
通过寻找共突变基因对,可以研究在癌症的发生与发展过程中被共同扰动的生物学功能,为揭示癌症的发生机制提供新的线索。目前,此类研究主要利用京都基因与基因组百科全书数据库(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)。由于KEG...
关键词:癌基因组 GENE ONTOLOGY 共突变 生物学功能 肺腺癌 
肾细胞癌DNA甲基化标记检测的重复性及其与基因表达改变的相关性被引量:1
《生物信息学》2011年第2期102-105,共4页姚晨 李红东 郭政 
国家自然科学基金(编号:30770558;30970668;81071646);黑龙江省杰出青年基金(编号:JC200808)
DNA甲基化是影响基因表达的重要因素之一。DNA甲基化芯片已广泛应用于寻找癌症的标志物,但是目前还没有研究对这些标志物的重复性进行评价。另外,DNA甲基化对基因表达的影响也存在争议。在本文中,通过分析肾细胞癌的两套甲基化数据,发...
关键词:肾细胞癌 DNA甲基化 表达 重复性 
全基因组DNA甲基化芯片数据批次效应的评价被引量:1
《数理医药学杂志》2011年第2期142-144,共3页姚晨 李红东 郭政 
国家自然科学基金项目(编号:30770558;30970668;81071646);黑龙江省杰出青年基金(编号:JC200808)资助
DNA甲基化芯片已广泛应用于癌症研究。但是有研究表明批次效应对基于高通量数据的研究有很大影响。癌症基因组计划(TCGA)数据库包含大量的不同批次的高通量甲基化数据。通过分析TCGA中7种癌症的数据,发现批次效应在各种类型的癌症数据...
关键词:TCGA 批次效应 甲基化芯片 
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