云南高校图书馆联盟文献共享服务平台- 国家自然科学基金(21073242)

国家自然科学基金(21073242): 作品数：17被引量：39H指数：4; 导出分析报告; 相关作者：豆育升唐红白明泽李鸿健张文英更多>>; 相关机构：重庆邮电大学电子科技大学教育部更多>>; 相关期刊：《计算机工程与设计》《Science China Chemistry》《湖南科技大学学报（自然科学版）》《物理化学学报》更多>>; 相关主题：分子动力学动力学模拟失活并行计算OPENMP更多>>; 相关领域：自动化与计算机技术理学电子电信化学工程更多>>

A semiclassical molecular dynamics of the photochromic ring-opening reaction of spiropyran被引量：1: 《Chinese Chemical Letters》2014年第5期727-731,共5页Gao-Hong Zhai Pei Yang Shao-Mei Wu Yi-Bo Lei Yu-Sheng Dou; supported by the National Natural Science Foundation of China (Nos. 21003100 and 21073242);Natural Science Basic Research Plan in Shaanxi Province of China (No. 2011JQ2013);Special Fund of Education Department of Shaanxi Province (No. 12JK0619); The photochromic ring-opening reaction of spiropyran（SP） has been investigated by a realistic semiclassical dynamics simulation,accompanied by SA3-CASSCF（12 10）/MS-CASPT2 potential energy curves（PECs） of S0–S2....; 关键词：Semiclassical dynamical simulation Spiropyran Photochromic ring-opening reaction Internal conversion

分子动力学模拟中Cache访问的分析与优化被引量：1: 《小型微型计算机系统》2014年第2期423-427,共5页赵文辉白明泽豆育升; 国家自然科学基金项目(21073242)资助; 为了提高分子动力学模拟计算在当前具有多级缓存(Cache)结构的处理器上的计算性能,对分子动力学模拟过程中缓存(Cache)的访问特征进行了分析与优化.通过对影响Cache命中率和模拟计算效率的因素进行测试与分析,提出一种Atomreorder算法....; 关键词：分子动力学缓存 CACHE命中率 Atom-reorder Program Performance Application Interface(PAPI)

短程力分子模拟在Hadoop上的实现及优化被引量：1: 《计算机工程与科学》2013年第2期26-31,共6页焦善飞何晨豆育升唐红; 国家自然科学基金资助项目(21073242); 在Hadoop开源云计算平台上运行分子模拟程序,具有节省软硬件投资、缩短模拟时间等研究意义。然而,该平台并不擅长科学计算类应用中所涉及的快速迭代和子任务间通信。为此,在原子分解法基础上提出了三种解决方案并利用"读写HDFS同步法"...; 关键词：分子动力学云计算原子分解法并行算法 HADOOP平台

基于调度器的Hadoop性能优化方法研究被引量：4: 《计算机工程与设计》2013年第1期190-194,共5页刘娟豆育升何晨唐红; 国家自然科学基金项目(21073242); 为了提高Hadoop调度器的调度性能,缩短Hadoop集群的任务整体响应时间,提出了一种基于CPU占用率的动态调度改进算法。首先对Hadoop传统的性能优化方法进行了对比,指出其存在问题的关键是缺乏动态性和灵活性。在此基础上,深入分析Hadoop...; 关键词：HADOOP 负载 CPU占用率云计算动态调度

5-甲基胞嘧啶及胞嘧啶无辐射失活的半经典动力学模拟和CASSCF计算被引量：1: 《物理化学学报》2012年第12期2803-2808,共6页袁帅马静张文英舒坤贤豆育升; 国家自然科学基金(21073242);重庆市自然科学基金(CSTC2011jjA00009; CSTC2009BB5419);重庆市教委科学技术项目(KJ120516)资助~~; 采用半经典动力学方法模拟了5-甲基胞嘧啶(5m-Cyt)和胞嘧啶(Cyt)在267nm紫外光辐射下的光物理失活过程.模拟发现,5m-Cyt和Cyt的激发态通过C5-C6键的扭曲以及甲基(或H5)和H6原子平面外振动失活.失活时,甲基(或H5)和H6原子几乎与环面垂直...; 关键词：5-甲基胞嘧啶胞嘧啶半经典动力学模拟 CASSCF 激发态寿命

Bonded excimer in stacked adenines:Semiclassical simulations: 《Science China Chemistry》2012年第7期1377-1383,共7页DOU YuSheng ZHAO WenHui YUAN Shuai ZHANG WenYing TANG Hong; supported by the National Natural Science Foundation of China (21073242);the Natural Science Foundation of Chongqing (cstc2011jjA00009);the Project of Science Technology Foundation of Chongqing Education Committee (KJ100507);the Research Fund of Chongqing University of Posts and Telecommunications (A2009-63,A2010-17); The nonradiative decay of a n-stacked pair of adenine molecules, one of which was excited by an ultrafast laser pulse, is studied by semiclassical dynamics simulations. This simulation investigation is focused on the ...; 关键词：stacked adenines bonded excimer semiclassical dynamics simulation

π堆积的腺嘌呤-胸腺嘧啶体系激发态电荷转移和无辐射失活的半经典动力学模拟被引量：2: 《物理化学学报》2012年第7期1676-1682,共7页张文英马静袁帅舒坤贤豆育升; 国家自然科学基金(21073242);重庆市自然科学基金(cstc2011jjA00009);重庆市教委科学技术项目(KJ120516)资助~~; 采用半经典电子-辐射-离子动力学(SERID)模型模拟了π堆积的腺嘌呤-胸腺嘧啶(A-T)体系激发态的光物理失活过程.设置激光脉冲仅作用于T,模拟发现电子由A转移到T,形成(A+T-)*激基缔合物(exciplex).当分子间距缩短至0.300nm时,由于轨道离...; 关键词：DNA碱基堆积效应激基缔合物电荷转移无辐射失活

基于OpenMP的Multi-Critical分子动力学并行算法优化被引量：4: 《计算机应用研究》2012年第7期2432-2434,共3页段振华白明泽豆育升; 国家自然科学基金资助项目(21073242); 为提高分子动力学模拟在多核共享内存式服务器上的运算速度,在现有的分子动力学并行算法基础上提出了Multi-Critical算法。该算法使用手动划分力矩阵的方法,使多个线程进入不同名的临界区,并使用分块叠加的方法优化了并行算法,提高了并...; 关键词：分子动力学并行计算多核处理器开放式多处理临界区

基于OpenMP的Winograd并行矩阵乘算法应用研究被引量：2: 《计算机应用研究》2012年第7期2435-2437,2441,共4页阳光亮李鸿健豆育升唐红; 国家自然科学基金资助项目(21073242); 为了提高半经典分子动力学模拟中矩阵乘法效率,通过一种稀疏矩阵分解方法化简矩阵乘法,基于OpenMP实现矩阵相乘的Winograd并行算法。该算法将Winograd算法中各部分依次采用OpenMP并行计算,降低了数据通信。在16核服务器上测试表明,该方...; 关键词：分子动力学矩阵乘 Winograd 并行计算加速比 OPENMP

MPI+TBB混合并行编程模型在分子动力学中的应用被引量：2: 《计算机应用研究》2012年第5期1772-1774,1794,共4页白明泽赵文辉豆育升孙世新温迪; 国家自然科学基金资助项目(21073242); 为了提高分子动力学模拟在对称多处理(SMP)集群上的计算速度,在分子动力学并行方法中引入MPI+TBB的混合并行编程模型。基于该模型,在分子动力学软件LAMMPS中设计并实现混合并行算法,在节点间采用MPI及空间分解技术实施进程级并行,节点...; 关键词：分子动力学混合并行编程模型 SMP集群 MPI 线程构建块

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