生物信息学

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大豆P34蛋白基因启动子克隆及其调控活性分析
《华北农学报》2025年第1期22-28,共7页桑莹莹 李珊珊 鲍薇 徐东 张雪 赵艳 
国家自然科学基金青年科学基金项目(32101694);黑龙江省植物性食品加工技术优势特色学科项目(YSTSXK202303)。
大豆P34蛋白主要存在于种子中,其上游启动子很可能具有调控下游基因在种子中高表达的特性。为进一步研究大豆P34蛋白基因的组织表达模式及其启动子的调控活性,通过qRT-PCR方法检测大豆P34蛋白基因在大豆不同组织中的表达情况;克隆大豆P3...
关键词：大豆 P34蛋白 启动子 生物信息学分析 转基因烟草 
大豆GmWRKY44生物信息学分析及功能验证
《华北农学报》2025年第1期29-35,共7页黄友举 于泳波 逄翠晶 孙轼絮 路晨 于延冲 
山东省重点研发计划项目(2022CXGC010401-02);山东省自然科学基金项目(ZR2021MC020)。
WRKY是植物特有的一类转录因子,在非生物胁迫应答、种子休眠与发芽、生长发育等方面起重要作用。为揭示大豆WRKY转录因子家族中GmWRKY44基因的功能和潜在的分子机制,对大豆Williams 82中GmWRKY44基因进行了生物信息学分析及功能验证。...
关键词：大豆 GmWRKY44 基因克隆 生物信息学分析 功能验证 盐胁迫 
lncRNA TCONS_00143126在奶牛乳腺上皮细胞炎症反应中的表达及生物信息学分析
《华北农学报》2025年第1期199-206,共8页冯芬 李彦霞 王晋鹏 董益闻 罗仍卓么 王兴平 
国家自然科学基金项目(32172709);宁夏自然科学基金项目(2023AAC03049);现代农业产业技术体系(CARS-36)。
为了深入探究lncRNA TCONS_00143126在E.coli型奶牛乳腺炎中的表达模式及其生物学功能,采用奶牛乳腺上皮细胞的cDNA为模板,运用PCR克隆及测序技术来确认lncRNA TCONS_00143126的存在,并进行lncRNA的亚细胞定位分析、预测可能靶向的miRN...
关键词：奶牛 lncRNA TCONS_00143126 乳腺上皮细胞 炎症 生物信息学分析 
牦牛PID1基因克隆、生物信息学及组织表达分析
《华北农学报》2024年第6期216-223,共8页余道宁 王佟 洛桑顿珠 平措占堆 张强 卓玛次仁 尼玛加措 张德荣 梁春年 
西藏自治区区域科技协同创新项目(QYXTZX-RKZ2022-03);国家重点研发计划项目(2022YFD1302101);现代肉牛牦牛产业技术体系项目(CARS-37)。
为研究牦牛磷酸酪氨酸互作结构域1基因(PID1)的结构及功能,并探究其在各组织中的表达情况,以桑桑牦牛脂肪组织cDNA为模板克隆桑桑牦牛PID1基因CDS区序列,并对其进行生物信息学分析。同时,采用实时荧光定量PCR方法(RT-qPCR),对牦牛的7个...
关键词：牦牛 PID1基因 基因克隆 生物信息学 
禽戊型肝炎病毒CaHEV-GDSZ01株ORF2蛋白的生物信息学分析、原核表达及多克隆抗体制备
《华北农学报》2024年第6期231-238,共8页张玉倩 吕志航 刘春红 廉春杨 张雪莲 
广东省基础与应用基础研究基金项目(2024A1515012840,2022A1515012194);广东省教育厅普通高校重点领域专项(乡村振兴)(2020ZDZX1004)。
旨在分析禽戊型肝炎病毒(aHEV)CaHEV-GDSZ01株ORF2蛋白的结构和生物学功能等,并利用大肠杆菌原核表达系统表达ORF2重组蛋白及制备抗ORF2蛋白多克隆抗体,验证重组蛋白的免疫原性和反应原性等。利用生物信息学软件对CaHEV-GDSZ01株ORF2蛋...
关键词：禽戊型肝炎病毒 ORF2蛋白 生物信息学 原核表达 多克隆抗体 
锦绣黄桃漆酶基因PpLAC7的克隆、亚细胞定位及表达分析
《华北农学报》2024年第5期72-79,共8页龚意辉 张灿美 周桂花 陈玫羽 谭倩 皮水勤 曾永贤 
湖南省自然科学区域联合基金项目(2024JJ7235)。
为克隆锦绣黄桃漆酶基因PpLAC7序列,分析PpLAC7基因序列信息及其在果肉褐变中的作用。以锦绣黄桃为试材,采用同源克隆方法从锦绣黄桃中获得漆酶基因PpLAC7的cDNA序列。采用生物信息学软件对PpLAC7基因的启动子元件、蛋白质理化性质、蛋...
关键词：锦绣黄桃 PpLAC7基因 果肉褐变 基因克隆 生物信息学分析 亚细胞定位 
玉米ZmPAP26b基因的克隆及其在干旱胁迫下表达模式分析
《华北农学报》2024年第4期10-19,共10页郭昭阳 殷宇航 刘钰 解一桐 裴玉贺 宋希云 赵美爱 
山东省农业良种工程(2019LZGC002)。
干旱胁迫对玉米生长发育造成严重影响,从而导致玉米产量降低。紫色酸性磷酸酶是一种参与植物多种生理生化功能的磷脂酶蛋白,为进一步深入研究紫色酸性磷酸酶家族基因在玉米抗逆过程中的作用,探究了ZmPAP26b基因在干旱胁迫下响应模式,利...
关键词：玉米 ZmPAP 干旱胁迫 原核表达 生物信息学 
玉米DUF668基因家族全基因组鉴定及其表达分析
《华北农学报》2024年第4期20-30,共11页夏轲 罗堰木 黄敏 杜何为 
国家自然基金面上项目(31771801;32072069);湖北省高等学校优秀中青年科技创新团队项目(T201704);湖北省自然科学基因创新群体项目(2022CFA030)。
未知功能域668(DUF668)家族是植物中一个功能尚不清楚的家族。为了解玉米DUF668基因家族成员及其特征,运用生物信息学方法对ZmDUF668基因家族进行鉴定分析。结果表明,玉米8条染色体上共分布19个ZmDUF668基因,分别命名为ZmDUF668-1~ZmDUF...
关键词：玉米 未知功能结构域668 基因家族 生物信息学 基因表达 
蓖麻PIP5K2基因克隆及功能预测
《华北农学报》2024年第4期72-79,共8页尹明达 罗蕊 任文静 王志妍 苏志敏 李茹鑫 陈圳 李玉玲 王艳 黄凤兰 
内蒙古民族大学创新创业项目(X2022043);内蒙古民族大学本科生创新训练项目(S202310136029)。
在植物中,磷脂酰肌醇4,5-二磷PIP5K基因家族中的PIP5K2基因在调控植物生长中起到了关键作用,为探明PIP5K2基因在蓖麻中的作用,以蓖麻PIP5K2基因为研究对象,对该基因进行基因克隆、生物信息学及表达分析。结果表明,以蓖麻cDNA为模板,通过...
关键词：蓖麻 PIP5K2基因 生物信息学分析 植物调控 基因表达 
绣球花铝转运蛋白HmALMT11的生物信息学及其表达特性分析被引量：1
《华北农学报》2024年第4期94-101,共8页王晓玥 陈双双 齐香玉 冯景 陈慧杰 孙明 邓衍明 
国家自然科学基金项目(32371956);江苏省农业科技自主创新资金项目(CX(22)2035);江苏省种业振兴“揭榜挂帅”项目(JBGS[2021]097)。
铝激活苹果酸转运蛋白(ALMT)是植物中广泛存在的一个基因家族,其编码的蛋白质在调控植物根部酸分泌和对铝离子的响应方面起着重要作用。为了明晰大花绣球无尽夏HmALMT11的序列特征及其在逆境胁迫后的表达特征,进一步探索大花绣球无尽夏...
关键词：绣球花 ALMT 铝胁迫 生物信息学分析 亚细胞定位 实时荧光定量PCR 
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