单核苷酸多态性分析

作品数:175被引量:620H指数:11
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杉木NAC转录因子基因ClNAC1的克隆、表达及单核苷酸多态性分析被引量:6
《林业科学》2018年第9期49-59,共11页魏明科 俞金健 黄晓龙 刘琼瑶 黄华宏 林二培 童再康 
国家重点研发计划项目(2017YFD0600201);浙江省农业新品种选育重大科技专项(2016C02056-5)
【目的】克隆与杉木次生壁形成相关的Cl NAC1基因,在组织表达特异性分析基础上开展该基因的单核苷酸多态性(SNP)及其连锁不平衡(LD)分析,以期为深入解析该基因功能和开展LD作图提供重要依据。【方法】基于杉木根、茎、叶等混合样本转录...
关键词:杉木 NAC转录因子 基因表达 SNP 连锁不平衡 
光皮桦BlSPL1转录因子基因的克隆、表达及单核苷酸多态性分析被引量:6
《林业科学》2013年第9期52-61,共10页李玉岭 周厚君 林二培 黄华宏 徐莉莉 童再康 
浙江省自然科学基金项目(Y3110453);浙江省农业科技重点项目(2011C12014);浙江省重点创新团队(2009R50035-9);浙江省农业科技重大专项(2008C02004-1);浙江农林大学研究生科研创新基金项目(3122013240218);浙江省重大科技专项(2009C12098)
Squamosa promoter binding protein like genes(SPLs)对植物开花具有重要的调控作用。基于转录组序列并利用RACE技术从光皮桦中分离获得BlSPL1基因,其cDNA序列全长1 825 bp,包含开放阅读框长1 170 bp,编码389个氨基酸,与桃PpSPL1(EMJ10...
关键词:光皮桦 转录因子 SPL基因 单核苷酸多态性 
牛枝子抗旱候选基因LpDREB的克隆与表达及单核苷酸多态性分析被引量:2
《林业科学》2012年第6期40-46,共7页李静 袁虎威 李伟 
国家自然科学基金项目(30901158)
牛枝子为胡枝子属中最具耐旱特性的灌木树种,是研究基于单核苷酸多态性(SNP)水平的植物个体间耐旱差异机制的重要材料。以5个种源的天然牛枝子为材料,利用染色体步移技术克隆牛枝子抗旱候选基因LpDREB的全长序列,对LpDREB基因的结构和...
关键词:牛枝子 LpDREB基因 诱导表达 序列分析 单核苷酸多态性 
杨树热激转录因子HsfA1d的克隆、表达及单核苷酸多态性分析被引量:1
《林业科学》2011年第7期82-90,共9页赵杏 郭琦 陈清清 李百炼 张德强 
国家林业公益性行业科研专项经费项目(201004009);教育部新世纪优秀人才支持计划专项基金(NCET-07-0084)
利用RT-PCR方法,首次由小叶杨受热激胁迫后构建的cDNA文库中扩增获得一热激转录因子HsfA1d cDNA克隆,测序结果表明克隆的PsHsfA1d cDNA片段总长为2036bp,基因内部含有完整的开放阅读框架,大小为1449bp,可编码长度为482个氨基酸残基的蛋...
关键词:小叶杨 HsfAld基因 热胁迫 诱导表达 单核苷酸多样性 
毛白杨PtDREB2A基因的克隆、表达及单核苷酸多态性分析被引量:6
《林业科学》2011年第4期49-56,共8页郭琦 王保垒 王博文 李百炼 张德强 
国家林业公益性行业科研专项经费项目(201004009);教育部新世纪优秀人才支持计划专项基金(NCET-07-0084)
利用基因特异的PCR引物由毛白杨受干旱胁迫后构建的cDNA文库中扩增获得一PtDREB2A cDNA克隆,并进行测序和序列分析,结果表明:PtDREB2A cDNA片段总长为946 bp,基因内部含有完整的开放阅读框架,大小为864 bp,可编码长度为287个氨基酸残基...
关键词:毛白杨 DREB2A基因 非生物胁迫 单核苷酸多态性 
毛白杨蔗糖合酶基因PtSUS1的克隆、表达及单核苷酸多态性分析被引量:3
《林业科学》2011年第3期52-58,共7页潘炜 田佳星 杜庆章 张志毅 张德强 
教育部新世纪优秀人才支持计划专项基金(NCET-07-0084);教育部科学技术研究重大项目(307006);国家自然科学基金项目(30600479;30872042);全国百篇优秀博士论文专项基金(200770)
利用RT-PCR方法,首次从毛白杨成熟木质部cDNA文库中分离出PtSUS1 cDNA全长,并进行了测序和序列分析。结果表明:克隆的毛白杨PtSUS1 cDNA片段总长为2703bp,基因内部含有完整的开放阅读框架,大小为2415bp,可编码长度为805个氨基酸残基的...
关键词:毛白杨 纤维素 蔗糖合酶 系统进化 单核苷酸多态性 
毛白杨纤维素合酶基因PtCesA4的克隆、表达及单核苷酸多态性分析被引量:9
《林业科学》2009年第5期1-10,共10页徐煲铧 杨晓慧 李百炼 张志毅 张德强 
国家自然科学基金项目(30600479,30872042);教育部科学技术研究重大项目(307006);全国百篇优秀博士论文专项基金(200770);长江学者专项基金资助
组合利用生物信息学和RT-PCR方法,首次从毛白杨未成熟木质部cDNA中分离出PtCesA4cDNA全长,并进行测序和序列分析,结果表明克隆的毛白杨PtCesA4 cDNA片段总长为3757bp,基因内部含有完整的开放阅读框架,大小为3129bp,可编码长度为1042个...
关键词:毛白杨 木质纤维素 纤维素合酶 单核苷酸多态性 
小叶杨GA20氧化酶基因的克隆、表达及单核苷酸多态性分析被引量:7
《林业科学》2009年第4期19-27,共9页卫尊征 郭琦 李百炼 张金凤 张德强 
教育部新世纪优秀人才支持计划专项基金(NCET-07-0084);人事部留学回国人员优秀类专项基金;国家自然科学基金(30600479;30872042);教育部科学技术研究重大项目(307006);全国百篇优秀博士论文专项基金(200770);长江学者专项基金资助
利用RT-PCR方法,首次从小叶杨未成熟木质部cDNA中分离出PsGA20OxcDNA全长及其基因组DNA,并进行测序和序列分析。结果表明:克隆的小叶杨PsGA20OxcDNA片段总长为1403bp,基因内部含有完整的开放阅读框架,大小为1155bp,编码区可编码长度为38...
关键词:小叶杨 赤霉素20氧化酶基因 组织特异性反转录PCR表达 单核苷酸多态性 
毛白杨干细胞决定基因Wuschel的克隆及其单核苷酸多态性分析被引量:9
《林业科学》2009年第1期43-49,共7页杨晓慧 张有慧 张志毅 李百炼 张德强 
国家自然科学基金项目(30600479,30872042);教育部科学技术研究重大项目(307006);全国百篇优秀博士论文专项基金(200770);长江学者专项基金资助
Wuschel(Wus)转录因子基因在维持干细胞群数量上具有关键性的调控作用。以模式植物拟南芥Wus为信息探针,在杨树基因组中共检测到2个Wus候选基因,并设计了基因特异的引物,从毛白杨形成层cDNA中分离得到长度分别为922bp和956bp的2个cDNA,...
关键词:毛白杨 植物干细胞 Wuschel基因 单核苷酸多态性 
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