扩增子

作品数:217被引量:773H指数:14
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相关机构:中国科学院生物技术有限公司中国农业大学中国科学院大学更多>>
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密封泡菜母水的真菌群落动态及与理化因子的相关性
《微生物学通报》2024年第5期1676-1689,共14页安睿 邓巍 李政强 李静超 杨晓燕 
国家自然科学基金(32371557);大理州科技专项(202301A020023)。
【背景】真菌对泡菜的风味与质地发挥着重要作用,影响泡菜及母水的储存时长。母水泡菜是我国的传统泡菜制作方法,也是保持泡菜原有风味的核心技术。【目的】解析密闭储存泡菜母水的真菌群落动态及与理化因子的关系。【方法】采用扩增子...
关键词:扩增子测序 泡菜母水 母水储存 稀有真菌 群落演替 
呼和浩特市周边地下水CPR和DPANN类群的检测及多样性分析被引量:1
《微生物学通报》2023年第12期5320-5336,共17页姜凯 曹春玲 红雨 宋枚汐 杨鸿臻 陈乌日娜 刘昱昕 
内蒙古自治区自然科学基金(2020BS03006);内蒙古师范大学基本科研业务费项目(2022JBQN091,2022JBTD010);内蒙古自治区科技计划(2020GG0039)。
【背景】候选门级辐射类群(candidate phyla radiation,CPR)和DPANN是与绝大多数已知细菌和古菌具有显著差异的独特类群,因发现较晚,人们对其认识还非常有限。已知二者类群庞大、存在广泛,但在不同生境中的多样性研究还较少,生态功能尚...
关键词:候选门级辐射类群(CPR) DPANN 宏基因组测序 16S rRNA基因扩增子测序 过滤富集 
混合菌剂施用对加工番茄生长及根际功能性微生物 群落的影响被引量:1
《微生物学通报》2023年第12期5363-5375,共13页周皓 范永斌 姚楠 陈珂玓 范方斌 包少杰 王爱英 张革 
国家大学生创新创业训练计划(202210759072)。
【背景】加工番茄为新疆种植红色产业重要的作物之一,加工番茄生产中存在传统配料过度施用的问题,“生物肥”逐渐受到人们关注。【目的】探究混合菌剂对加工番茄生长的影响,激发根际土壤功能性微生物种群的变化,为未来微生物菌剂的开发...
关键词:混合菌剂 加工番茄 16S rRNA基因扩增子分析 功能性微生物 
宁夏地区春季奶牛场牛舍土壤细菌群落特征
《微生物学通报》2022年第11期4686-4698,共13页杨双鸣 任文义 苟妍 张力莉 徐晓锋 
宁夏回族自治区重点研发项目(20190410110)。
【背景】现代规模化生产模式下,牛舍环境管理是影响奶牛高效健康生产的重要因素。【目的】探讨牛场不同牛舍土壤细菌群落特征,为奶牛健康生产提供理论依据。【方法】采集宁夏某规模化奶牛场的哺乳犊牛岛、断奶犊牛舍、育成牛舍、低产泌...
关键词:16S rRNA基因扩增子测序 牛舍土壤 细菌群落 
PCR反应条件对16S rRNA基因扩增子测序准确性的影响被引量:1
《微生物学通报》2022年第7期2527-2537,共11页赵枫 史亚 王莹 梁倩 陈欢 李樱红 窦晓兵 何陆平 
中国科技部科技基础资源调查专项(2021FY100901)。
【背景】16S rRNA基因扩增子测序技术是一种不依赖培养而获得样本中细菌种群结构、相对丰度等信息的方法。高通量测序技术实验步骤较多,每一步骤细微的差别都可能在最终的测序结果中放大,并造成测序结果与实际情况的偏差。【目的】基于M...
关键词:16S rRNA基因 反应条件 靶向测序 
中高温大曲制作过程中火圈真菌菌群演替规律及其风味功能被引量:10
《微生物学通报》2021年第11期4178-4189,共12页周天慈 孙佳 朱雨婕 何宏魁 周庆伍 曹润洁 马叶胜 杜海 徐岩 
江苏省自然科学基金(BK20201341);国家重点研发计划(2018YFC1604100)。
【背景】大曲真菌为白酒发酵过程提供发酵剂和糖化剂,火圈为白酒生产提供重要的风味物质,但针对火圈真菌的菌群演替规律及风味功能尚不清楚。【目的】探索中高温大曲火圈真菌菌群演替规律及风味功能,为优化制曲工艺,提升白酒品质提供理...
关键词:中高温大曲火圈 真菌 内转录间隔区扩增子测序 顶空固相微萃取结合气相色谱质谱联用 理化参数 群落结构与演替规律 
酱香型白酒发酵过程中核心酵母的鉴别及其功能被引量:9
《微生物学通报》2020年第11期3504-3514,共11页宋哲玮 杜海 聂尧 徐岩 
国家自然科学基金(31530055);国家科技攻关计划(2016YFD0400503,2018YFC1604100)。
【背景】酵母是酱香型白酒发酵过程中最重要的微生物,但酵母群落中核心酵母的种类和功能尚不清晰。【目的】通过探索酱香型白酒发酵微生物群落中核心酵母的种类和功能,为揭示酱香型白酒酿造机制以及提升白酒品质提供理论支撑。【方法】...
关键词:微生物群落 核心酵母 内转录间隔区扩增子测序 宏转录组测序 模拟发酵 群落结构和功能 
16S/18S/ITS扩增子高通量测序引物的生物信息学评估和改进被引量:29
《微生物学通报》2020年第9期2897-2912,共16页吴悦妮 冯凯 厉舒祯 王朱珺 张照婧 邓晔 
国家自然科学基金(91851106,U1906223,31861133002);中国科学院前沿科学重点研究项目(QYZDB-SSW-DQC026)。
【背景】在过去的十几年里,基于核糖体RNA基因的扩增子测序技术被广泛用于各种生态系统中微生物群落的多样性检测。扩增子测序的使用极大地促进了土壤、水体、空气等环境中微生物生态的相关研究。【目的】随着高通量测序技术的不断发展...
关键词:扩增子测序 16S rRNA基因 ITS基因 18S rRNA基因 PCR扩增 引物 引物覆盖度 引物特异性 扩增产物片段长度 
基于16S rRNA基因扩增子测序分析日本囊对虾肠道菌群结构与功能的特征被引量:15
《微生物学通报》2020年第6期1857-1866,共10页曾晨爔 林茂 李忠琴 马英 王淑红 
公益性行业科研专项(201203085);厦门市海洋与渔业发展专项资金(18CZP001HJ06);福建省自然科学基金(2019J01695)。
【背景】肠道菌群在对虾的生理活动中起关键作用。日本囊对虾是我国海水养殖虾类中的主要品种之一,迄今为止有关其肠道菌群结构与功能的研究还鲜有报道。【目的】利用高通量测序技术探究日本囊对虾肠道菌群的组成结构与功能作用,揭示虾...
关键词:日本囊对虾 16S rRNA基因扩增子测序 肠道菌群 功能预测 
基于amoA基因扩增子高通量测序的氨氧化古菌多样性分析方法被引量:4
《微生物学通报》2018年第9期1861-1870,共10页何翔 吴佳鹏 焦黎静 温晓梅 王岩 欧林坚 洪义国 
国家自然科学基金(41576123);国家重点基础研究发展计划(2015CB452902);广州市科学研究专项重点项目(201504010005);广州大学百人计划人才引进启动基金(GZHU-B-05)~~
【背景】对于环境样品中氨氧化古菌(Ammonia-oxidizing archaea,AOA)多样性的研究,利用amoA功能基因作为分子标记会比16SrRNA基因有更强的特异性和更高的分辨率,能更准确地反映环境样品中氨氧化古菌的种群结构和分布特征。然而,目前对a...
关键词:功能基因 参考数据库 相似性阈值 AMOA基因 氨氧化古菌 
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