癌症基因

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基于TCGA数据库的子宫内膜癌不良预后预测模型构建
《医学综述》2025年第7期893-896,F0003,共5页卢琴琴 黄玉秀 陈兰钦 
目的基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库构建子宫内膜癌不良预后预测模型。方法从TCGA数据库中下载并整理445例子宫内膜癌患者的临床资料以及生存资料,利用单因素分析筛选子宫内膜癌患者生存相关病理特征,采用多因素Logistic回归分析确定...
关键词:子宫内膜癌 癌症基因组图谱数据库 病理因素 预后 
癌症基因组框内突变功能注释及计算方法比较分析
《电子科技大学学报》2025年第2期311-320,共10页刘清瑞 刘婕 岳振宇 夏俊峰 
国家自然科学基金(U22A2038)。
框内突变是编码区插入缺失突变的一种常见类型,与癌症的发生发展密切相关。然而,计算方法在癌症驱动框内突变预测方面的有效性尚缺乏明确共识。首先,系统地比较和评估了8种计算方法,证实了它们在识别癌症驱动框内突变的适用性及可靠性...
关键词:框内突变 癌症 性能评估 数据库构建 
基于癌症基因组图谱数据库双硫死亡相关LncRNA构建肝细胞癌预后模型及其效能分析
《实用肝脏病杂志》2025年第1期128-131,共4页牛日雨 王益杰 王欣 李成忠 
目的鉴定与双硫死亡相关长链非编码RNA(DRLs)相关的肝细胞癌(HCC)预后特征并构建预后模型。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中获取HCC数据,基于单因素COX回归、套索回归(LASSO)和多因素COX回归筛选DRLs,构建HCC预后模型并验证模型效...
关键词:肝细胞癌 长链非编码RNA 预后模型 双硫死亡 癌症基因组图谱数据库 
前列腺癌细胞焦亡相关基因预后分析及NLRP1对前列腺癌细胞焦亡的调节作用
《现代泌尿外科杂志》2025年第1期73-81,共9页马晓璐 陈嘉钦 冯隽龙 赵琦 王彬 
目的利用基因表达数据库分析前列腺癌(PCa)细胞焦亡相关基因(PRGs)与PCa预后的关系,探究核苷酸结合寡聚化结构域样受体1(NLRP1)在PCa细胞焦亡中的调节机制。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库、基因表达综合数据库(GEO)获取PCa、癌旁正...
关键词:前列腺癌 细胞焦亡 核苷酸结合寡聚化结构域样受体1 癌症基因组图谱数据库 
给肿瘤“做核酸”:分子病理破译癌症基因密码
《科学生活》2024年第11期38-39,共2页王祥 
病毒感染后进行“核酸检测”,老少妇孺尽人皆知,但给肿瘤细胞“做核酸”可能不是人人都知道的。肿瘤患者的病理报告中,会经常看到“建议加做基因检测”等语句,临床医生在问诊时也常会询问肿瘤患者“基因检测做了吗”。那么,肿瘤患者接...
关键词:核酸检测 临床医生 分子病理 基因检测 病理报告 肿瘤患者 癌症基因 肿瘤细胞 
富含亮氨酸重复序列/Ⅲ型纤维连接蛋白4在胃癌组织中的表达及临床意义
《消化肿瘤杂志(电子版)》2024年第3期327-333,共7页李引 林青雨 钱辰 周侦 翟二涛 
国家自然科学基金(82003112)。
目的探讨富含亮氨酸重复序列/Ⅲ型纤维连接蛋白4(leucine-rich repeat and fibronectin typeⅢdomain-containing protein 4,LRFN4)在胃癌组织中的表达情况,并分析LRFN4表达水平与胃癌患者临床病理参数和预后的关系。方法收集2017年1月...
关键词:胃癌 富含亮氨酸重复序列/Ⅲ型纤维连接蛋白4 癌症基因组图谱数据库 生物标志物 胃癌预后 
构建铜代谢相关基因的肾透明细胞癌预后模型
《安徽医药》2024年第9期1801-1805,共5页卫鑫 吴波 陈勇全 胡玮璟 王东文 
山西省“1331工程”重点创新团队建设计划项目(3c332019001)。
目的构建基于铜代谢相关基因和临床病理学特征的新型肾透明细胞癌(ccRCC)预后模型。方法2022年6月至2023年1月从基因集数据库(MSigDB)5.1版整理出铜代谢相关基因,应用癌症基因组图谱(TCGA)中ccRCC数据对获取的铜代谢相关基因进行生物信...
关键词:肾透明细胞癌 铜代谢 基因组 癌症基因组图谱数据库 基因表达综合数据库 预后模型 
构建SUMOylation相关基因的结直肠癌患者临床预后模型
《哈尔滨医科大学学报》2024年第4期389-395,共7页苏丹 阮玉莉 马铭 刘超 王岩 
目的筛选与SUMOylation过程密切相关的基因,并构建结直肠癌的预后基因表达模型。方法从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中下载与结直肠癌相关的转录组数据和临床资料,结合基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analy...
关键词:结直肠癌 SUMOylation相关基因 预测模型 列线图 癌症基因组图谱数据库 
焦亡相关基因与胃癌预后及免疫浸润的相关性分析
《中国医药导报》2024年第21期35-45,共11页吴云青 王承霞 谢东宇 
江苏省镇江市科技计划项目(SS2021005)。
目的通过生物信息学筛选胃癌预后焦亡相关基因(PRGs),构建和评估风险模型并分析PRGs与免疫浸润的相关性,验证胃癌治疗的新靶点。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库获取胃癌的转录组和临床数据并筛选差异表达的PRGs。采用单因素Cox回归及...
关键词:胃癌 焦亡相关基因 癌症基因组图谱数据库 预后风险模型 免疫浸润 
基于癌症基因组图谱数据库的胶质瘤中协同调控免疫和线粒体能量代谢关键基因筛选及其免疫浸润分析
《肿瘤研究与临床》2024年第7期496-502,共7页华丹 葛强 常留栓 贺一凡 史永恒 
国家自然科学基金(82302908);天津市自然科学基金(16JCQNJC13400);中国留学基金委项目(201606945004);中央高校基本科研业务费专项资金资助项目(3332021084);天津医科大学总医院“卓越新星”培育项目(2020年)。
目的基于生物信息学方法筛选胶质瘤中协同调控免疫和线粒体能量代谢的关键基因,探讨这些基因与免疫浸润的关系。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中收集671例胶质瘤样本(肿瘤组)和5例非肿瘤脑组织样本(对照组),数据下载时间为2023年11...
关键词:胶质瘤 免疫浸润 线粒体 能量代谢 
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