PRAM

作品数:46被引量:75H指数:5
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PRAM和LARPBS模型上有向序列翻转距离并行算法(英文)
《软件学报》2007年第11期2683-2690,共8页沈一飞 陈国良 张强锋 
No.60533020(国家自然科学基金重点项目)~~
分别在两种重要并行计算模型中给出计算有向基因组排列的反转距离新的并行算法.基于Hannenhalli和Pevzner理论,分3个主要部分设计并行算法:构建断点图、计算断点图中圈数、计算断点图中障碍的数目.在cREW-PRAM模型上,算法使用O(n^2)处理...
关键词:并行算法 光总线并行模型 反转距离 基因组重排 序列比较 CREW-PRAM模型 
PRAM和LARPBS模型上的近似串匹配并行算法被引量:19
《软件学报》2004年第2期159-169,共11页钟诚 陈国良 
国家重点基础研究发展规划(973)No.G1998030403;国家高技术研究发展计划(863)No.2001AA111041~~
近似串匹配技术在网络信息搜索、数字图书馆、模式识别、文本挖掘、IP路由查找、网络入侵检测、生物信息学、音乐研究计算等领域具有广泛的应用.基于CREW-PRAM(parallel random access machine with concurrent read and exclusive wri...
关键词:近似串匹配 并行算法 CREW-PRAM(parallel random access machine with concurrent read and EXCLUSIVE write) 可重构光总线系统 编辑距离 汉明距离 
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