武华北

作品数:6被引量:14H指数:2
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供职机构:天津大学计算机科学与技术学院更多>>
发文主题:LINUX并行计算HMM基因识别生物信息学更多>>
发文领域:自动化与计算机技术生物学更多>>
发文期刊:《计算机应用研究》《光盘技术》《计算机工程与应用》《计算机与信息技术》更多>>
所获基金:天津市科技支撑重点项目国家自然科学基金天津市应用基础与前沿技术研究计划国家重点新产品计划更多>>
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Cell BE环境中BF算法并行化及性能优化被引量:1
《计算机工程》2010年第6期35-38,共4页张旭明 于策 孙济洲 武华北 
天津市科技支撑计划基金资助重点项目(09ZCKFGX00400);天津市应用基础及前沿技术研究计划基金资助重点项目(08JCZDJC19700)
BF(Brute Force)算法在Cell BE环境中的并行化及性能优化研究是此类算法向CellBE环境迁移的基础。根据CellBE独特的结构及算法本身的特点,采用计算-加速的编程模型实现并行化,分析评价双缓冲、Mailbox、DMA-list机制对BF算法性能的影响...
关键词:BF算法 CELL BE处理器 并行化 性能优化 
面向混合并行计算系统编程环境的研究与实现被引量:2
《计算机科学》2010年第4期143-145,178,共4页武华北 孙济洲 王文义 
国家自然科学基金项目(10778623);天津市科技支撑重点项目(09ZCKFGX00400)资助
分析了基于CMP节点的混合并行计算系统并行处理模式,基于分层次的自顶向下、逐步细化的思想,设计并实现了面向此类混合并行计算系统的编程环境,从而大大降低程了序设计人员在此类环境下编写并行应用程序的复杂度,减少了程序编码错误,提...
关键词:多核微处理器 共享缓存 消息传递 混合并行计算系统 并行程序设计 
FJRR:一种基于阵列型数据划分应用的并行设计模式
《计算机应用研究》2010年第1期134-137,共4页汤善江 孙济洲 于策 武华北 徐祯 
国家自然科学基金资助项目(10778623);国家"863"计划资助项目(2006AA12A105);天津市科技支撑重点资助项目(09ZCKFGX00400);天津市应用基础及前沿技术研究计划重点项目(08JCZDJC19700)
并行设计模式能够降低并行编程的难度与复杂度。针对科学与工程计算领域大量耗时的数据密集型应用的计算,提出了一种能够适用于阵列数据划分应用的FJRR并行设计模式;鉴于开发者更习惯串行编程,在FJRR模式中提出并实现了一种类串行化并...
关键词:并行设计模式 代码骨架 轮循 类串行化并行编程 阵列型数据划分 
基于HMM的基因识别并行计算
《计算机与信息技术》2007年第10期26-27,共2页王栋 李靖 武华北 宋婷 
分析了传统的串行基因分析方法的局限性,阐述了基于隐马尔科夫模型的基因识别方法和原理,最后给出了基于隐马尔科夫模型的并行算法并进行了并行效果分析,指出了并行计算在生物信息学领域的广阔前景及重要意义。
关键词:基因识别 HMM 并行计算 生物信息学 
基于HMM的基因识别并行计算
《光盘技术》2007年第5期48-49,共2页王栋 李靖 武华北 宋婷 
本文分析了传统的串行基因分析方法的局限性,阐述了基于隐马尔科夫模型的基因识别方法和原理,最后给出了基于隐马尔科夫模型的并行算法并进行了并行效果分析,指出了并行计算在生物信息学领域的广阔前景及重要意义。
关键词:基因识别 HMM 并行计算 生物信息学 
Linux中进程间信号通信机制的分析及其应用被引量:11
《计算机工程与应用》2005年第3期108-110,115,共4页王文义 武华北 
国家重点新产品计划项目(编号:2002ED782017)资助
对于多用户、多任务的操作系统,进程间的通信(Inter-ProcessCommunication,IPC)是非常重要的,它是使整个系统得以有条不紊工作的基础。Linux操作系统提供了多种IPC机制,如信号、管道、信号量、消息队列、共享内存和套接字等。其中信号...
关键词:LINUX 进程间通信IPC 进程 信号 
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