宋新蕊

作品数:4被引量:8H指数:2
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反向虚拟筛选平台及应用
《生物信息学》2015年第4期251-256,共6页张媛 刘雨桐 李达 宋新蕊 周雪松 赵勇 
北京市东城区科技计划(2015-2-006)支持;北京市科学技术研究院创新团队计划(IG201305C2)支持
靶标确证是老药新用、药物毒副作用研究的关键。基于分子对接方法 Auto Dock Vina和内部构建的疾病靶标数据库,采用分布式架构,构建了反向虚拟筛选平台。应用该平台对药物吡斯的明进行靶标确证,最终成功找到其靶标乙酰胆碱酯酶,验证了...
关键词:老药新用 毒副作用 反向虚拟筛选 AUTO DOCK VINA 
计算机辅助药物筛选平台及应用被引量:3
《生物信息学》2014年第4期300-304,共5页宋新蕊 李达 陈洁 赵勇 
北京市科学技术研究院创新团队计划(IG201305C1)支持
先导化合物发现是创新药物研发的最重要环节之一。针对目前海量功能不明确的小分子化合物,本文构建了一个用来实现快速发现先导化合物,有效降低药物研发成本的计算机辅助药物筛选平台。该平台采用分布式架构思想,集成了Auto Dock Vina...
关键词:虚拟筛选 超算平台 AUTO DOCK VINA 化合物库 先导化合物发现 
宏基因组的生物信息分析被引量:5
《生物信息学》2013年第4期282-286,共5页赵勇 黄劲松 宋新蕊 陈禹保 童贻刚 
北京市科学技术研究院海外人才专项资助(0TP-2012-001)
基于高通量测序的宏基因组学研究是近年来的研究热点之一。宏基因组的生物信息分析正在逐渐完善成熟,各种分析软件和流程的开发与应用,极大地促进了宏基因组研究的发展,特别是在遗传与进化、基因发现、宏基因组和人类疾病的相关研究等...
关键词:宏基因组 生物信息学 高通量测序 
基于结构的单绕蛋白聚类图构建与分析
《生物信息学》2013年第1期44-49,共6页宋新蕊 李晓琴 
北京市自然科学基金(4112010);北京市教委科技发展计划面上项目资助
蛋白质分子进化规律研究是分子进化研究的重点,对揭示生命起源与进化机制有重要意义。本文对已知空间结构及物种信息的单绕蛋白,利用结构比对信息,构建了不同层次单绕样本系统聚类图。分析发现:功能相似蛋白存在明显聚集现象,同一超家...
关键词:单绕 结构比对 系统聚类 物种进化 
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