赵雅男

作品数:1被引量:4H指数:1
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供职机构:中国科学技术大学计算机科学与技术学院更多>>
发文主题:索引序列比对算法索引技术生物序列比对生物信息学更多>>
发文领域:自动化与计算机技术生物学更多>>
发文期刊:《计算机工程》更多>>
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序列比对算法中的BW变换索引技术研究及其改进被引量:4
《计算机工程》2016年第1期282-286,共5页赵雅男 徐云 程昊宇 
国家自然科学基金资助重点项目(61033009);国家"111"计划基金资助项目(B07033)
面向大规模长序列的序列比对问题是生物信息学中最重要的基础问题之一。针对序列比对算法的主流索引技术BW变换(BWT)进行研究,提出一种新的二阶BWT索引方法。与传统BWT方法的逐位索引查找不同,改进后的BWT方法按双位索引查找。实验结果...
关键词:序列比对 索引 BW变换索引 第二代测序 第三代测序 大规模长序列比对 
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