陈聪

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供职机构：浙江师范大学数理与信息工程学院更多>>
发文主题：FSADNA最长公共子序列统计算法有限状态自动机更多>>
发文领域：自动化与计算机技术更多>>
发文期刊：《计算机工程》更多>>
所获基金：浙江省科技厅新苗人才计划更多>>
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基于FSA的DNA重复体频率统计算法
《计算机工程》2011年第11期184-186,189,共4页陈聪 韩建民 贾泂 辛德东 
2010年浙江省新苗人才计划基金资助项目(2010R404017)
针对现有DNA重复体频率统计算法效率低、灵活性差等不足,基于字符串多模式匹配的有限状态自动机,构造DNA子序列比对自动机,利用KMP算法对自动机进行状态转移优化,由此提出一种高效的重复体频率统计算法。该算法通过对DNA数据库的线性扫...
关键词：有限状态自动机 DNA子序列 重复体频率 频率统计算法 最长公共子序列 
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