PCK1与TSX抑制剂相互作用的分子对接及分子动力学模拟研究  

作　　者：曹锟 王若男 熊兴东 刘新光 

机构地区：[1]广东医科大学广东省医学分子诊断重点实验室,衰老研究所,生物化学与分子生物学研究所,广东东莞523808 [2]广东医科大学科研平台服务管理中心,广东东莞523808

出　　处：《中文科技期刊数据库（全文版）医药卫生》2022年第12期253-256,共4页

摘　　要：磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶1(PCK1)是调节糖异生途径的限速酶,其活性中心能够催化草酰乙酸生成磷酸烯醇式丙酮酸(PEP)并消耗1分子GTP。1-烯丙基-3-丁基-8-(N-乙酰基-4-氨基苄基)-黄嘌呤(TSX抑制剂)是一种黄嘌呤类化合物,属于GTP类似物。本研究通过分子对接发现,GTP或TSX抑制剂具有共同的潜在结合位点。分子动力学模拟的结果表明,与apo-PCK1相比,GTP-PCK1和TSX-PCK1具有更低的均方根偏差(RMSD)与回旋半径(Rg),说明结合配体分子能促使PCK1整体构象更加稳定。这些结果表明TSX可能竞争GTP的结合位点,从而达到抑制PCK1催化功能的作用。本研究从原子构象水平揭示了TSX抑制剂与PCK1相互作用的机制,为治疗II型糖尿病等衰老相关疾病提供理论基础。

关 键 词：分子对接 分子动力学模拟 磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶 抑制剂 稳定性 

分 类 号：R914[医药卫生—药物化学]