肝素与HIV-1膜表面蛋白gp120相互作用的预测和模拟  

Prediction and Simulation on Interaction Between HIV-1 Envelope Protein gp 120 and Heparin

作　　者：阎作伟[1] 胡远东[2] 李松[2] 江涛[1] 

机构地区：[1]中国海洋大学海洋药物与食品研究所,青岛266003 [2]军事医学科学院药物毒物研究所,北京100850

出　　处：《高等学校化学学报》2004年第3期522-525,392,共5页Chemical Journal of Chinese Universities

基　　金：国家自然科学基金 (批准号 :2 0 3 710 43 )资助

摘　　要：用分子模拟软件研究肝素与 HIV-1膜表面蛋白 gp1 2 0的相互作用 .将肝素中的单糖、二糖和三糖片段作为探针对 gp1 2 0蛋白进行搜索 ,统计分析确定肝素结合区域 .用肝素六糖片段和结合区域进行反应分子对接 ,获得两种结合模式 .最终建立的模型能够很好地解释肝素体外抑制 HIV-1的现象 。Molecular simulation software are used to investigate the interaction between HIV 1 envelope protein gp 120 and heparin. Monosaccharide, disaccharide and trisaccharide of heparin are used as the probe molecules to make a global search around protein gp 120. After statistics analysis, we found the most favorable binding domain on gp 120 to heparin, and got two binding model which could be used to interpret the phenomenon that heparin could inhibit HIV 1 in vitro very well by docking heparin hexasacchar...

关 键 词：GP120 肝素结合区域 探针 分子对接 

分 类 号：R96[医药卫生—药理学]