仿刺参cDNA文库构建以及序列分析  

Construction and analysis of cDNA library from the sea cucumber Stichopus japonicus

作　　者：徐赛涛[1] 丛丽娜[1] 朱蓓薇[1] 

机构地区：[1]大连工业大学,生物与食品工程学院,辽宁,大连,116034 大连工业大学,生物与食品工程学院,辽宁,大连,116034 大连工业大学,生物与食品工程学院,辽宁,大连,116034

出　　处：《中国水产科学》2007年第z1期7-11,共5页Journal of Fishery Sciences of China

基　　金：国家自然科学基金(30571449);973计划前期研究(2006CB708210).

摘　　要：应用Gubler-Hoffman cDNA Library Construction技术,构建仿刺参(Apostichopus japonicus)cDNA文库.测试结果表明,库容量为2.0×106 pfu/mL,利用PCR方法检测cDNA文库插入DNA片段的大小,其长度范围在0.5～4.1 kb,插入片段平均长度为1.3kb,表明该文库达到建库要求,可用来筛选低丰度mRNA的基因克隆.随机挑选100个1kb以上的cDNA克隆进行测序分析,发现有25条EST序列和网上公布的其他物种的序列相似性较高,这些基因与刺参能量代谢和蛋白水解相关.其中发现的几个重要基因,如编码遍在蛋白以及缬酪肽蛋白等的基因,可能与仿刺参自溶过程的蛋白酶水解和细胞凋亡事件相关,进一步的研究还在进行.另有49条EST序列相似性较低,推测可能是功能未知的新基因.仿刺参cDNA文库的成功构建,为下一步大量EST序列分析和功能性新基因的发现,以及从基因水平认识仿刺参这一特殊棘皮动物的生长、发育和代谢规律奠定了基础.

关 键 词：仿刺参 CDNA文库 蛋白水解 

分 类 号：Q785[生物学—分子生物学]