人工锌指蛋白(ZFP)的设计及原核表达分析  

Engineering and Expression of Sequence-specific DNA-binding Zinc Finger Protein

作　　者：魏勇[1] 应大君[1] 侯春丽[1] 朱楚洪[1] 崔晓萍[1] 邢艳[1] 郭洪峰[1] 

机构地区：[1]第三军医大学解剖学教研室 重庆市生物力学与组织工程重点实验室 第三军医大学解剖学教研室 重庆市生物力学与组织工程重点实验室,重庆400038

出　　处：《生物医学工程学杂志》2008年第3期662-667,共6页Journal of Biomedical Engineering

基　　金：国家自然科学基金资助项目(30472027,30770575,30700771)

摘　　要：本实验通过生物信息学手段人工设计了与A20基因启动子区特定靶序列特异作用的锌指蛋白结合域。首先对A20基因启动子进行了结构及功能分析,把经过分析获取的A20启动子区的目标序列提交Scrips研究院的ZF Tools在线服务器,经序列比较,成功获取了A20启动子区特定的18bp靶序列及与这一靶序列特异性作用的锌指蛋白的氨基酸序列。进一步利用生物信息学手段对获取的锌指蛋白进行了序列特征分析及结构模建。把锌指蛋白的DNA优化序列重组于原核表达载体pTYB11上,并成功进行了原核表达。研究表明,利用生物信息学手段,人工设计特定的锌指蛋白可行,为进一步设计完整的人工转录因子,进而干预A20基因的表达奠定了基础。This experiment was aimed to create A20 gene site-specific zinc finger DNA-binding protein. The sequence of A20 gene promoter was analyzed with bioinformatics means and submitted to ZF Tools Server at TSRI. Using the database of the web site, we determined the A20 gene valid target sites and designed the amino acid sequence of zinc finger protein predicted to be bound to the target site. And then, the structure of the protein sequence was analyzed and homology was modeled with various bioinformatics means. ...

关 键 词：锌指蛋白 启动子 生物信息学 同源模建 原核表达 

分 类 号：Q78[生物学—分子生物学]