副本交换分子动力学模拟方法计算Trp-cage熔解温度  

THE MELTING TEMPERATURE OF TRP- CAGE EVALUATED BY REPLICA EXCHANGE MOLECULAR DYNAMICS METHOD

作　　者：段莉莉[1] 扈国栋[1] 张庆刚[1] 

机构地区：[1]山东师范大学物理与电子科学学院,250014,济南 山东师范大学物理与电子科学学院,250014,济南 山东师范大学物理与电子科学学院,250014,济南

出　　处：《山东师范大学学报（自然科学版）》2009年第3期30-31,45,共3页Journal of Shandong Normal University(Natural Science)

基　　金：国家自然科学基金资助项目(10874104);山东省自然科学基金资助项目(Z2007A05)

摘　　要：副本交换分子动力学模拟方法用来计算Trp-cage小蛋白的熔解温度.此模拟采用的是AMBER03的分子力场,但是它的电荷用最近发展的极化的蛋白质专一性电荷来代替.隐式溶剂模型用来模拟溶剂影响,温度变化范围从247.7 K到645.6 K.计算的熔解温度是312 K,这一结果和实验值吻合的很好(315 K).

关 键 词：副本交换 TRP-CAGE 熔解温度 

分 类 号：O641.12[理学—物理化学]