TNF-α拮抗肽拮抗机制的计算机模拟研究  

Exploring the function mechanism of TNF-α antagonist peptides using computational simulation program

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作  者:李朝[1] 岳俊杰[1] 程度胜[1] 黄培堂[1] 

机构地区:[1]军事医学科学院生物工程研究所,北京100071

出  处:《生物技术通讯》2004年第5期464-466,共3页Letters in Biotechnology

摘  要:为了了解从肽库中筛选到的TNF-α拮抗肽的作用机制,用分子模拟程序模建了4条肽序列(TBP1、2、3、6)的结构,然后利用分子对接程序建立了它们与TNF-α作用的理论模型。在得到的模型中,拮抗肽TBP2、3与TNF-α相互作用的区域位于TNF-α分子中形成三聚体的区域,提示这些肽是通过影响TNF-α三聚体的形成而发挥作用的。To gain a better understanding of the antagonist peptides screened formerly from a peptide library, the model of four peptides(TBP1,2,3,6) were constructed using the graphic molecular modeling program. The binding model of antagonist peptides to TNF-α was presented using an automated docking program. Result shows that the antagonist peptides TBP2 and TBP3 interact with the trimer forming area of TNF-α which indicating that the peptides exert their effect through influencing the forming of TNF-αtrimer.

关 键 词:TNF-α 拮抗肽 拮抗机制 计算机模拟研究 肽库 作用机制 TBP 分子对接 序列 相互作用 

分 类 号:Q516[生物学—生物化学] R735.7[医药卫生—肿瘤]

 

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