大规模蛋白质功能预测方法的进展  

The Progress of Protein Function Prediction on a Large Scale

作　　者：曾岚[1] 徐晋麟[1] 李亦学[2] 石铁流[2] 

机构地区：[1]上海交通大学生命科学技术学院,上海200240 [2]中国科学院上海生命科学研究院生命信息中心,上海200031

出　　处：《生命的化学》2005年第1期4-7,共4页Chemistry of Life

基　　金：国家高科技(863)资助项目(No.2002AA231051;No.2001AA231011)

摘　　要：全基因组测序的快速发展在获得大量序列信息的同时也迫切需要获取功能信息,用生物信息学方法进行大规模蛋白质功能预测在这种需求中获得发展。这些预测方法从基于序列同源性发展到基于genomic -context获得功能相关蛋白质对。基于genomic- context的方法具体有基因融合、染色体邻近、相似系统发生谱等。由于各种方法的偏向性,最新的趋势是整合多种方法的数据,组成蛋白质相互作用网络,通过分析网络的结构进行蛋白质功能预测。

关 键 词：功能预测:genomic—context 网络 

分 类 号：Q51[生物学—生物化学] Q75