CDK4与靛玉红及其衍生物复合物结构的模建  

Molecular Models of Cyclin-dependent Kinase 4 Complexed with Indirubin and Its Analogues

作　　者：张娜[1] 蒋勇军[1] 邹建卫[1] 曾敏[1] 胡桂香[1] 俞庆森[1] 

机构地区：[1]浙江大学宁波理工学院分子设计与营养工程市重点实验室,宁波315104

出　　处：《化学学报》2005年第9期809-813,i002,共6页Acta Chimica Sinica

基　　金：宁波市博士基金(Nos.2004A610010;2004A610018)资助项目.

摘　　要：细胞周期蛋白依赖性激酶(Cyclin-dependentKinases,CDKs)是细胞周期调控的重要因子,也是治疗癌症的一类重要的药物靶标.靛玉红是传统中药当归龙荟丸中治疗慢性疾病的有效成分,靛玉红及其衍生物5-磺酸基-靛玉红对CDKs具有有效的抑制作用.以获得晶体结构的CDK2与5-磺酸根-靛玉红的复合物为模板,通过同源模建和分子对接的方法构建出的CDK4与靛玉红及其衍生物的结合模式.结合CDK4与两种抑制剂的复合物结构,解释了靛玉红和衍生物5-磺酸基-靛玉红之间抑制活性的差别,同时也分析了5-磺酸基-靛玉红对CDK2和CDK4不同选择性的原因.所建CDK4结构为进一步进行基于结构的抗癌药物设计提供了合理的模型.Indirubin and its analogue, indirubin-5-sulphonic acid, have shown potent ability to inhibit cyclin-dependent-kinases (CDKs). Using the crystal structure of CDK2 complexed with indirubin-5sulphonate as the template, models of CDK4 complexed with indirubin and its analogue were built by homology modeling and molecular docking. The structure comparisons of CDK4 with indirubin and its analogue could explain different inhibition ability. Moreover, the different activity of indirubin-5-sulphonic acid complexed with CDK2 and CDK4 was also illustrated. The model structure provided the basis for designing more potent anticancer drug.

关 键 词：靛玉红 衍生物 复合物 细胞周期蛋白依赖性激酶 细胞周期调控 CDK2 磺酸基 有效成分 慢性疾病 药物靶标 晶体结构 抑制作用 CDKS 结合模式 分子对接 同源模建 抑制活性 药物设计 磺酸根 抑制剂 治疗 

分 类 号：Q26[生物学—细胞生物学]