基于对齐的生物序列相似性分析  被引量:2

Alignment-based biological sequences similarity analysis

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作  者:张少宏[1] 戴宪华[2] 

机构地区:[1]汕头大学电子系,汕头515063 [2]中山大学电子系,广州510275

出  处:《生物信息学》2005年第2期81-84,共4页Chinese Journal of Bioinformatics

基  金:国家自然科学基金(60474075)。

摘  要:生物序列相似性(或差异性)分析是生物信息学研究的一种重要的方法。其中基于对齐的生物序列相似性分析方法,重点介绍基于隐马尔可夫模型的比较方法,并比较基于对齐的各种生物序列分析方法的优缺点。It is very important to analysis biological sequences by comparing their similarity or dissimilarity in the research on bioinformatics. We present an overview of those conventional alignment-based methods, in particular the method based on the HMM model. In the end we discuss and compare their advantages and disadvantages.

关 键 词:相似性分析 对齐 隐马尔可夫模型 生物序列分析 生物信息学 序列相似性 比较方法 差异性 优缺点 

分 类 号:TP391.41[自动化与计算机技术—计算机应用技术] TP319[自动化与计算机技术—计算机科学与技术]

 

参考文献:

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