生物序列分析

作品数：18被引量：20H指数：2
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深度学习在生物序列分析领域的应用进展被引量：2
《北京工业大学学报》2022年第8期878-887,共10页张冀东 王志晗 刘博 
国家自然科学基金资助项目(62076015)。
随着生物技术的不断发展和生物学数据的大量产出,传统生物学数据分析方式不足以应对日益复杂庞大的生物序列数据.面对这种情况,国内外学者逐步将深度学习应用到生物学分析中,利用其处理高维数据的优势,取得了一系列进展,并成为生物序列...
关键词：深度学习 生物信息学 生物序列分析 核酸 基因 蛋白质 
Robustness and Statistical Significance of PAM-like Matrices for Cognate Identification
《通讯和计算机（中英文版）》2010年第12期21-31,共11页Antonella Delmestri Nello Cristianini 
关键词：同源配对 统计意义 PAM 鲁棒性 学习系统 识别 矩阵 生物序列分析 
科学出版社生命科学分社新书推介 2010-08
《中国生物化学与分子生物学报》2010年第10期891-891,共1页
生物序列分析（生物信息学数据分析丛书）,MicroRNA——从基础科学到疾病生物学（生命科学前沿）
关键词：科学出版社 生命 MICRORNA 学分 生物序列分析 生物信息学 数据分析 科学前沿 
基于MATLAB的矩阵在生物序列分析中的应用
《池州学院学报》2008年第5期66-69,共4页钱长春 左先波 
在MATLAB平台上利用M语言创建相应函数,改变相应参数建立PAM和BIOSUM矩阵,对多序列比对进行验证分析,找出最好的比对结果,标记基因差异位点进而建立系统树进行分析。结果表明:利用MATLAB开放性的语言特点对基因序列等进行生物信息学研...
关键词：MATLAB M语言 基因序列 矩阵 生物信息学 
HMM在生物序列分析中的应用
《闽江学院学报》2007年第5期52-55,共4页陈雄峰 
阐明HMM的基本理论与概念,进而总结介绍HMM应用的基本问题与算法;重点介绍并分析了可用于表示序列家族的几种HMM结构特点,并说明了利用已知家族Profile HMM构造多序列比对的方法;阐述了常用于基因发现的GHMM和目前常用于发现基因结构的...
关键词：HMM 序列家族 基因发现 
基于支持向量机的生物序列分析
《计算机仿真》2006年第9期69-71,共3页晏春 王正志 
国家自然科学基金(60471003)
支持向量机是一种比较新的机器学习方法,它满足结构风险最小的要求,并且能够适用于高维的特征空间,因此在生物序列分析中得到了广泛地应用。结合基因序列的特点,提出了一种新的核函数--位置权重子序列核函数。这个核函数融合了基因序列...
关键词：支持向量机 核函数 生物序列分析 
生物序列分析中的若干数学方法被引量：2
《高校应用数学学报（A辑）》2005年第4期379-392,共14页谢惠民 
国家重点基础研究发展规划课题(G2000077308)
生物序列是由4种核苷酸组成的核酸序列和由20种氨基酸组成的蛋白质序列.论文介绍生物序列研究中的计数方法、组分分析方法、隐马尔可夫模型方法以及它们的某些应用.
关键词：生物序列 计数问题 组分分析方法 隐马尔可夫模型 
基于BioJava的生物序列分析软件的设计
《河南科技大学学报（自然科学版）》2005年第6期55-58,共4页唐四薪 李义兵 何红波 
国家自然科学基金资助项目(60371046)
根据生物信息研究工作中对基因数据处理的实际需要,通过对生物大分子序列分析软件需具备的功能进行分析,并按照面向对象的方法,采用BioJava为开发工具,设计和开发了一个适用于生物序列分析的专用软件(SEQAnalysis),该软件具有独特的序...
关键词：生物大分子序列 基因 生物信息 序列分析 
含先验信息的学习机在生物序列分析中的应用
《计算机应用》2005年第9期2169-2170,共2页刘颖 林元烈 覃征 
国家自然科学基金资助项目(10371063);国家科技攻关项目(2004BA711A21);国家863计划资助项目(2003AA412020)
生物序列分析是机器学习和数据挖掘技术一个重要的应用领域。它的特别之处在于,很多有领域背景的先验知识可以在分析过程中得到利用,从而改善分析的效果。在对蛋白质的乙酰化修饰的预测过程中,通过合理地利用先验信息,改进模式提取方法...
关键词：先验信息 生物序列分析 机器学习 支持向量机 
基于对齐的生物序列相似性分析被引量：2
《生物信息学》2005年第2期81-84,共4页张少宏 戴宪华 
国家自然科学基金(60474075)。
生物序列相似性(或差异性)分析是生物信息学研究的一种重要的方法。其中基于对齐的生物序列相似性分析方法,重点介绍基于隐马尔可夫模型的比较方法,并比较基于对齐的各种生物序列分析方法的优缺点。
关键词：相似性分析 对齐 隐马尔可夫模型 生物序列分析 生物信息学 序列相似性 比较方法 差异性 优缺点 
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