含先验信息的学习机在生物序列分析中的应用  

Application of prior-knowledge-bearing learning machine in biological sequence analysis

作　　者：刘颖[1] 林元烈[2] 覃征[1] 

机构地区：[1]清华大学软件学院,北京100084 [2]清华大学数学科学系,北京100084

出　　处：《计算机应用》2005年第9期2169-2170,共2页journal of Computer Applications

基　　金：国家自然科学基金资助项目(10371063);国家科技攻关项目(2004BA711A21);国家863计划资助项目(2003AA412020)

摘　　要：生物序列分析是机器学习和数据挖掘技术一个重要的应用领域。它的特别之处在于,很多有领域背景的先验知识可以在分析过程中得到利用,从而改善分析的效果。在对蛋白质的乙酰化修饰的预测过程中,通过合理地利用先验信息,改进模式提取方法,能够显著地提高支持向量机模型的预测性能。Biological sequence analysis is an important application domain of data mining technology. Its particularity lies in that a great deal of prior knowledge can be utilized to improve the learning process. In the research of the protein modification of N-acetylation, by properly using prior knowledge and upgrading the pattern extraction method, improvement in performance of the SVM model was achieved.

关 键 词：先验信息 生物序列分析 机器学习 支持向量机 

分 类 号：TP181[自动化与计算机技术—控制理论与控制工程]