志贺氏菌属鲍氏(S.boydii)亚群基因组组成与进化分析  

作　　者：张笑冰[1] 王璟[1] 彭俊平[1] 杨娥[1] 宾文[1] 杨剑[1] 董杰[1] 孙立连[1] 徐星晔[1] 金奇[1] 

机构地区：[1]病毒基因工程国家重点实验室,北京100176

出　　处：《中国科学（C辑）》2005年第4期359-364,共6页Science in China(Series C)

基　　金：国家重大基础研究规划项目(批准号:G1999054103);国家高技术研究发展计划项目(批准号:2001AA223011);国际科技合作重点项目(批准号:2001AA223116)

摘　　要：利用比较基因组杂交法(comparativegenomichybridization,CGH)对志贺氏菌属鲍氏(S.boydii)亚群共18个血清型代表菌株的基因组结构组成进行比较分析,结果显示,该亚群基因组的“共有骨架”包含2552个与非致病性大肠杆菌K12同源的ORFs.比对K12基因组,该亚群所有菌株基因组共同缺失ORFs为199个,主要涉及外膜蛋白编码基因和O-抗原合成相关基因,而属于亚群特异性的ORFs主要以噬菌体基因和未知功能ORFs为主,一些参与铁离子代谢、运输和Ⅱ型分泌系统基因在大多数的鲍氏菌株中存在.以比较基因组杂交法得到的进化分析显示:鲍氏亚群18个血清型代表菌株可分为4组,其中13型与其他菌株有较大的差异.这种分组结果与某些代谢相关的基因分布情况存在对应关系.通过对该亚群“共有骨架”、缺失基因和株特异基因,以及进化分类等方面的分析,以期探索该亚群基因组的进化规律,并为志贺氏菌属鲍氏亚群的致病机理、疫苗研制和药物开发等方面的研究提供重要线索.

关 键 词：志贺菌属鲍氏亚群 比较基因组杂交 株特异性ORFs 进化 比较基因组 进化分析 志贺氏菌 结构组成 亚群 致病性大肠杆菌 

分 类 号：Q933[生物学—微生物学]