多维蛋白鉴别技术分析天蓝色链霉菌膜内侧蛋白质组  

Analyses of Streptomyces coelicolor inner Membrane Proteome by Multidimentional Protein Identification Technology

作　　者：石宣明[1] 罗元明[1] 张贵锋[2] 苏志国[2] 黄玉碧[3] 杨克迁[1] 

机构地区：[1]中国科学院微生物研究所微生物资源前期开发国家重点实验室,北京100080 [2]中国科学院过程工程研究所生化工程国家重点实验室,北京100080 [3]四川农业大学玉米研究所,雅安625014

出　　处：《生物工程学报》2005年第5期814-819,共6页Chinese Journal of Biotechnology

基　　金：中国科学院知识创新基金资助。~~

摘　　要：链霉菌是一类具有重要工业价值和复杂调控机制的微生物,天蓝色链霉菌是这个属的模式菌。已报道天蓝色链霉菌的蛋白组学的研究多采用二维聚丙烯酰胺凝胶电泳与基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱相结合的方法,但由于膜蛋白疏水性较强,天然丰度较低,此法得到的膜蛋白很少。用蛋白酶K保护高pH蛋白酶K法制备链霉菌膜内侧蛋白组样品,并用多维蛋白鉴别技术进行分析,得到154个可能的膜内侧蛋白(包括膜内在蛋白和膜外周蛋白),其中含跨膜区的膜内在蛋白44个,含3个以上跨膜区的膜内在蛋白有23个。此外,还鉴定了一批膜内侧蛋白的亲水性肽段及其在膜上的拓扑位置。该结果有助于对天蓝色链霉菌的膜蛋白进行拓扑学分类和功能研究。Streptomyces coelicolor is the model species among streptomycetes. Until now, proteomic analyses of S. coelicolor have been conducted using two-dimensional polyacrylamide gel electrophoresis and matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry method, few integral membrane proteins were identified due to the hydrophobic and lowabundance nature of these proteins. In this work, 154 possible inner membrane proteins from S. coelicolor were identified using high pH-proteinase K sample preparation method and multidimensional protein identification technology, among them 44 are integral membrane proteins containing at least one transmembrane domain, most peptides and their corresponding proteins were identified experimentally for the first time.

关 键 词：天蓝色链霉菌 多维蛋白鉴别技术 膜蛋白组 蛋白酶K 质谱 拓扑学 

分 类 号：Q51[生物学—生物化学]