截形苜蓿吡哆醇生物合成基因的电子克隆和进化分析  

作　　者：李蕊[1] 孟宪萍[1] 胡英考[1] 蔡民华[1] 李雅轩[1] 

机构地区：[1]首都师范大学生命科学学院,北京100037

出　　处：《江苏农业科学》2007年第1期81-84,共4页Jiangsu Agricultural Sciences

基　　金：北京市教委科技发展计划项目基金资助(200310028112)

摘　　要：电子克隆是随着基因组计划和EST计划实施而发展起来的、利用生物信息学手段进行基因克隆的新方法。根据物种间同源基因相对保守的特点,利用生物信息学的方法,以拟南芥吡哆醇生物合成蛋白基因(PDX)cDNA序列为探针,在GenBank的HTGs数据库中找到与之高度同源的截形苜蓿的基因组序列———m th2-17p16克隆,通过GenScan软件预测和序列拼接得到了截形苜蓿吡哆醇生物合成基因序列(GenBank登录号为DQ139263)。用该序列对GenBank中的est-others进行相似性搜索,获得了25条截形苜蓿的EST序列,经拼接后发现与基因组预测的基因序列一致,表明该基因是真实存在和表达的。该cDNA序列长度为1 257 bp,具有完整的开放式阅读框(ORF 29-973bp),推测编码314个氨基酸。通过对日本百脉根(Lotus corniculatusvar.japoni-cus)、烟草(Nicotiana tabacum)、拟南芥(Arabidopsis thaliana)、大豆(Glycine max)、小麦(Triticum aestivum)和水稻(O ryza sativa)等进行吡哆醇生物合成蛋白序列同源比较,发现该基因具有高度的保守性。

关 键 词：电子克隆 截形苜蓿 吡哆醇 生物合成基因 EST 

分 类 号：S503.52[农业科学—作物学]