基于药物数据报道数据库的虚拟组合片段库构建  

作　　者：张珉[1] 盛春泉[1] 徐辉[1] 宋云龙[1] 张万年[1] 

机构地区：[1]第二军医大学药学院,上海200433

出　　处：《中国科学（B辑）》2007年第3期288-294,共7页Science in China(Series B)

基　　金：国家863计划(批准号:2002AA233091);国家自然科学基金重点项目(批准号:30430750)资助

摘　　要：对药物数据报道数据库中142553个药物分子进行统计分析,提取得到了这些药物分子的共同结构特征.根据药物分子的结构特征将其拆分为环结构、侧链和连接子,共整理得到32017个片段结构,其中环结构13642个、侧链10076个、连接子8299个.为更好地指导全新药物设计,利用拆分片段构建了三个虚拟组合片段数据库:用环结构和侧链组合方式构建了药效基团库,含有34244个片段;用环结构的刚性特点构建了基本骨架库,含有片段13574个;直接利用连接子构建了连接片段库,含有连接片段8051个.库中所有片段都经过能量优化,均具有合理的构型和构象,可以用于虚拟组合库的构建和全新药物设计.

关 键 词：药物设计 片段 分子数据库 统计分析 药物分子 

分 类 号：TQ460.1[化学工程—制药化工]