改进的非齐性空间反应扩散主方程的随机模拟  

Improved Algorithm for Stochastic Simulation of Reaction-Diffusive Master Equation in Inhomogeneous Space

作　　者：刘祥[1] 周文[1] 闫正楼[1] 王翼飞[1] 

机构地区：[1]上海大学数学系,上海200444

出　　处：《应用科学学报》2007年第6期651-656,共6页Journal of Applied Sciences

基　　金：国家自然科学基金(30571059);国家"863"高技术研究发展计划(2006AA02Z190)资助项目

摘　　要：提出一种改进的下一子空间算法,与原先的下一子空间算法相比,可以模拟更为复杂空间结构中的生化反应,并在某些情况下还可以降低计算量.该文以一个生化反应系统为例,分别利用原先的下一子空间算法和该文的改进算法进行了模拟.结果表明,在某些条件下该文提出的改进算法可以明显地减少模拟所需的计算量.We proposed an improved next subvolume method in this paper. Numerical results show that the proposed method can be applied to biochemical reactions systems with complex spatial structure, indicating significant improvement in efficiency compared to existing approaches under some conditions.

关 键 词：基因调控网络 反应扩散方程 Gillespie算法 下一子空间方法 

分 类 号：Q612[生物学—生物物理学]