基因本体及其注释数据语义网模型  被引量:1

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作  者:黄钰[1] 许庆炜[1] 刘谦[1] 张国庆[2] 李亦学[2] 鲁强[1] 

机构地区:[1]华中科技大学生物医学光子学教育部重点实验室,武汉430074 [2]上海生物信息技术研究中心,上海200235

出  处:《科学通报》2007年第22期2618-2624,共7页Chinese Science Bulletin

基  金:国家高技术研究发展计划(批准号:2006AA02Z343;2006AA02A312);国家重点基础研究发展计划(批准号:2003CB715901);上海科委重大项目(批准号:06DZ22920)资助

摘  要:目前基因本体在语义网研究领域还很滞后,无法提供复杂的语义查询和推理服务.本研究通过将异构的原始数据以统一的RDF(resource description framework)格式进行编写,建立跨基因子本体的语义映射,并在此基础上引入一系列的推理规则集,提出了一个RDF语义网模型——GORouter.进一步,通过选择OracleNDM(network datamodel)作为RDF容器,使得RDF语义推理结果能够与传统的关系型查询无缝结合在一起,最终为用户提供了一个基于GORouter的混合解决方案(http://www.scbit.org/gorouter/).

关 键 词:基因本体 语义网 本体映射 ORACLE NDM 

分 类 号:Q75[生物学—分子生物学]

 

参考文献:

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引证文献:

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