基因本体

作品数:211被引量:874H指数:15
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基于加权基因共表达网络分析探讨急性胰腺炎相关脓毒症潜在的关键基因
《安徽医药》2025年第5期940-944,I0002,I0003,I0004,共8页桑珍珍 冯顺易 李勇 
河北省科技厅医学科学研究重点计划项目(182777156)。
目的旨在识别急性胰腺炎相关脓毒症的关键基因。方法2023年3―9月从GEO数据库下载基因数据集。采用WGCNA确定急性胰腺炎和脓毒症的枢纽模块,并将两个模块交叉以确定与急性胰腺炎相关脓毒症有关的共同基因。采用R软件筛选出急性胰腺炎和...
关键词:急性胰腺炎 脓毒症 关键基因 加权基因共表达网络分析 基因本体论 
二至丸对多发性骨髓瘤治疗后骨髓抑制作用机制的网络药理学研究
《华西药学杂志》2025年第2期139-144,共6页陈孟斯 陈明 费晓莉 濮迁 张开基 
四川省科技厅资助项目(2020YJ0438)。
目的采用网络药理学及分子对接方法研究二至丸治疗骨髓抑制(BMS)的物质基础及机制。方法利用中药系统药理学数据库与分析平台,获取二至丸中的活性成分及作用靶点,通过Swisstarget、TargetNet数据库补充化合物靶点;通过OMIM、Genecards...
关键词:骨髓抑制 二至丸 多发性骨髓瘤 网络药理学 基因本体 基因组百科全书 分子对接 作用机制 
基于机器学习的衰老基因特征选择与分类
《实验科学与技术》2025年第2期84-89,共6页曾洁 吴全旺 李德辉 高俊敏 
国家自然科学基金面上项目(62172065);重庆市教改项目(213029);重庆大学教改项目(2021Y34)。
设计了基于机器学习的衰老基因特征选择与分类实验,作为面向智能医学工程等专业的“机器学习基础”课程的实验内容。该实验通过将衰老基因映射至基因本体来获得实验数据集,利用特征选择方法处理基因本体内的冗余性,并使用朴素贝叶斯、...
关键词:特征选择 分类 机器学习 衰老基因 基因本体 
熏倒牛抗惊厥活性的网络药理学研究及验证
《华西药学杂志》2025年第2期145-152,共8页李明珠 岳会兰 曲江勇 刘增根 
国家自然科学基金资助项目(批准号:32170394);中国科学院西部之光青年学者A类项目(2019)。
目的通过网络药理学、分子对接、分子动力学模拟和动物实验验证,探究熏倒牛抗惊厥的潜在作用机制。方法采用Lipinski′s five rules和Swiss Target Prediction数据库筛选活性成分及其靶点,利用在线网站和数据库获得目标化合物与抗惊厥...
关键词:熏倒牛 抗惊厥 基因本体 基因组百科全书 网络药理学 分子对接 分子动力学模拟 黄酮类化合物 
miR-204-3p靶基因预测及其功能的生物信息学分析
《医药前沿》2025年第6期1-4,共4页张诗蒙 孙宇飞 谭志容 栗俊杰 庄严 
深圳市南山区卫生科技计划(NS2022048)。
目的预测并分析miR-204-3p的靶基因特性及其功能影响。方法采用microT-CDS与miRDB两个数据库进行靶基因预测,取两个数据库的交集作为靶基因集合进行基因本体(GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果microT-CDS...
关键词:微RNA miR-204-3p 靶基因 生物信息学 基因本体 京都基因和基因组数据库 
食蟹猴CCl4给药前后的血清差异蛋白鉴定
《生物技术》2025年第1期44-49,共6页苗玉发 李伟 
国家“重大新药创制”科技重大专项(2018ZX09201017-001-003)。
[目的]比较雌性和雄性食蟹猴CCl4给药前后及性别间的血清差异蛋白。[方法]12只食蟹猴CCl4给药前以及给药后48 h,取血制备血清。部分血清用于肝酶测定,部分血清用于蛋白质提取。采用iTRAQ和LC-MS/MS技术,对蛋白质进行鉴定。[结果]CCl4给...
关键词:食蟹猴 蛋白质组学 iTRAQ技术 液相色谱质谱串联 性别差异 基因本体 京都基因和基因组百科全书 蛋白质互相作用网络 
艾塞那肽改善糖尿病小鼠症状的核心基因探究
《生物技术》2024年第6期707-714,787,共9页程优 刘影 房敬尧 甄若楠 朱黎娜 牛文彦 
国家自然科学基金面上项目(82270856);天津市医学重点学科(专科)建设项目(TJYXZDXK-032A);天津医科大学朱宪彝纪念医院科研基金资助项目(2019ZDKF08,ZXY-YJJ2021-3);天津中医药大学第二附属医院科研基金资助项目(QMJH202122)。
[目的]探究艾塞那肽治疗糖尿病的机制和靶基因。[方法]下载数据集筛选差异表达基因,构建疗效相关的共表达网络筛选加权基因,选取两组数据交集基因并使用蛋白互作网络确立核心基因,使用糖尿病模型小鼠验证核心基因。[结果]共获取15个交...
关键词:艾塞那肽 2型糖尿病 生物信息学 枢纽基因 血清和糖皮质激素诱导的激酶-1 加权基因共表达网络分析 基因本体论 差异表达基因 
YTHDF2基因在急性髓细胞白血病中的生物信息学研究
《国际输血及血液学杂志》2024年第5期411-421,共11页周仁龙 张勇刚 黄国清 周平 唐丹丹 
广东省自然科学基金面上项目(2022A1515012542)。
目的基于生物信息学方法研究m^(6)A RNA结合蛋白(YTHD)F2基因在急性髓细胞白血病(AML)中的表达及临床意义。方法从UCSC Xena数据库癌症基因组图谱(TCGA)Pan-Cancer(PANCAN)数据集中提取YTHDF2 mRNA在泛癌(34种癌症样本,N=10535,G=60499)...
关键词:白血病 髓样 急性 YTHDF2蛋白 人类 RNA甲基化 蛋白质相互作用图 基因本体 m^(6)A 生物信息学 
基于GEO和TCGA数据库分析胃癌发生发展关键靶点的研究
《继续医学教育》2024年第8期188-192,共5页张思淼 任丽莉 
2020年辽宁省教育厅科学研究经费项目(JYTJCZ R2020075)。
目的阐明胃癌(gastric cancer,GC)组织与癌旁组织之间的基因表达差异,并评估其预后价值。方法从基因表达综合(gene expression omnibus,GEO)数据库中选取3个GC微阵列数据集(GSE79973、GSE54129和GSE19826),limma包分析GC和癌旁组织间基...
关键词:胃癌 GEO数据库 TCGA数据库 基因本体论 京都基因与基因组百科全书 
高尿酸血症状态下低度炎症的病理特点研究被引量:1
《世界中医药》2024年第13期1881-1888,共8页褚梦真 王雨 林志健 黄晶 刘亚迪 殷晓阳 张冰 
国家自然科学基金联合基金项目(U20A20406);国家自然科学基金青年科学基金项目(82104475);张冰全国名老中医药专家传承工作室建设项目(国家中医药人教函[2022]75)。
目的:探讨高尿酸血症(HUA)状态下低度炎症的病理特点。方法:根据体质量随机将迪法克鹌鹑分为正常组、模型组,每组10只。以普通饲料:酵母浸膏粉=4∶1制备食饵,并以该食饵喂养模型组鹌鹑,正常组鹌鹑则自由饮食饮水。分别于造模第10、20、3...
关键词:高尿酸血症 低度炎症 病理特点 鹌鹑 炎症介质 蛋白芯片技术 酶联免疫吸附试验法 基因本体/京都基因与基因组百科全书富集分析 
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