启动子序列的非均衡检测识别算法  

Imbalanced recognition algorithm for promoter sequence

作　　者：罗泽举[1] 宋丽红[2] 陆胜[1] 

机构地区：[1]重庆工商大学计算机科学与信息工程学院,重庆400067 [2]重庆工商大学经济管理实验教学中心,重庆400067

出　　处：《计算机应用》2008年第8期2094-2096,2108,共4页journal of Computer Applications

基　　金：重庆市科委自然科学基金资助项目(2007BB2205);重庆市教育委员会科学技术研究资助项目(KJ0707022)

摘　　要：通过改进Hessian矩阵对角参数,调整支持向量机中超平面的位移,将数据量少的样本从两类非均衡样本中进行分离,结合隐马尔可夫随机迭代,实验发现,不能简单固定Hessian矩阵的对角参数,而必须加之以可调整的权系数才能控制错分的样本数.对启动子序列进行识别,平均识别率达到92.8%。By improving the Hessian matrix diagonal parameter, adjusting the hyperplane displacement and separating the few samples from two-class imbalaneed samples, with reference to the hidden Markov random iterated algorithm, the experiment indicates that we cannot simply fix the diagonal parameter of Hessian matrix, and must add proper weight coefficient that can be adjusted to control the number of error-divided samples, recognize promoter sequence. The average recognition rate comes to 92.8%.

关 键 词：HESSIAN矩阵 非均衡算法 隐马尔可夫模型 启动子识别 

分 类 号：TP391.4[自动化与计算机技术—计算机应用技术] TP181[自动化与计算机技术—计算机科学与技术]