DNA序列特征提取方法研究  

Feature Selection Research on DNA Sequence

作　　者：蔡春[1] 苗立峰[2] 邓乃扬[2] 

机构地区：[1]北京联合大学应用文理学院,北京100083 [2]中国农业大学理学院,北京100083

出　　处：《北京联合大学学报》2008年第4期70-72,79,共4页Journal of Beijing Union University

基　　金：国家自然科学基金资助项目(10371131)

摘　　要：针对DNA序列分类问题提出了两种特征提取方法,利用可分支持向量分类机间隔大、推广能力强的原理建立了DNA序列特征提取方法优劣的评价标准,利用该标准把本文的两种特征提取方法进行了比较,且跟以往的DNA序列特征提取方法进行了比较。实验表明,提出的两种特征方法得到的DNA序列特征完全能够代表DNA序列,对已知分类样本的预测率为100%,且此特征提取方法有很强的推广能力。Two methods for feature selection are put forward for DNA sequences label problem. The feature selection criteria are proposed by seperated support vector machines theory. Many feature selection methods are compared accordingly. The results： The two feature selection methods presented in this paper can classify the known label DNA sequences in 100% accuracy and get high generalization precision.

关 键 词：DNA序列 特征提取 支持向量分类机 预测率 

分 类 号：Q523[生物学—生物化学]